Do you want to publish a course? Click here

Molecular Characterization of Jabali Goats Using SSR

التوصيف الجزيئي لمجموعة من المعز السوري باستخدام تقانة SSR

1404   0   1   0.0 ( 0 )
 Publication date 2018
and research's language is العربية
 Created by Shamra Editor




Ask ChatGPT about the research

The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic diversity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using 7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of 4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3 alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527 genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.


Artificial intelligence review:
Research summary
تتناول هذه الدراسة التوصيف الجزيئي لمجموعة من المعز السوري باستخدام تقانة SSR (التوابع البسيطة الترادفية). تم جمع 42 عينة من المعز السوري من عدة محطات تربية مختلفة، بما في ذلك المعز الجبلي والشامي والهجين. تم استخراج الحمض النووي (DNA) من هذه العينات وتطبيق تقانة SSR باستخدام 7 مؤشرات جزيئية. أظهرت النتائج وجود 29 أليلًا بمعدل 4.1 أليل لكل موقع جيني. تراوح عدد الأليلات لكل موقع من 3 أليلات في المؤشرات الجينية (BMS1714، INRAD07، SRCRSP09) إلى 8 أليلات في المؤشر الجيني SRCRSP01. كما تراوحت نسبة تكرار الأليلات عبر جميع المواقع الجينية المدروسة من 0.071429 للأليل ذو الحجم الجزيئي 210 bp للموقع الجيني McM527 إلى 0.97619 للأليل ذو الحجم الجزيئي 55 bp للموقع الجيني SRCRSP09. تهدف الدراسة إلى تقييم التنوع الوراثي للمعز السوري ومعرفة درجة القرابة الوراثية بين الأفراد من خلال رسم شجرة القرابة الوراثية وتحليل البنية الوراثية.
Critical review
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة خطوة مهمة في مجال التوصيف الجزيئي للمعز السوري، حيث تسلط الضوء على التنوع الوراثي والقرابة بين الأنواع المختلفة. ومع ذلك، هناك بعض النقاط التي يمكن تحسينها. أولاً، كان من الممكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل عدد أكبر من العينات ومحطات التربية المختلفة للحصول على نتائج أكثر شمولية. ثانياً، لم يتم التطرق بشكل كافٍ إلى العوامل البيئية التي قد تؤثر على التنوع الوراثي. ثالثاً، كان من الممكن استخدام تقانات جزيئية إضافية لتعزيز دقة النتائج. على الرغم من هذه النقاط، فإن الدراسة تقدم مساهمة قيمة في فهم التنوع الوراثي للمعز السوري وتفتح الباب لمزيد من الأبحاث في هذا المجال.
Questions related to the research
  1. ما هو الهدف الرئيسي من هذه الدراسة؟

    الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو تقييم التنوع الوراثي لمجموعة من المعز السوري باستخدام تقانة SSR ومعرفة درجة القرابة الوراثية بين الأفراد.

  2. كم عدد الأليلات التي تم اكتشافها في هذه الدراسة؟

    تم اكتشاف 29 أليلًا بمعدل 4.1 أليل لكل موقع جيني.

  3. ما هي تقانة SSR المستخدمة في هذه الدراسة؟

    تقانة SSR (التوابع البسيطة الترادفية) هي تقنية تستخدم لتحديد التباينات الجينية بين الأفراد من خلال تحليل تكرار التوابع البسيطة في الحمض النووي.

  4. ما هي النتائج الرئيسية التي توصلت إليها الدراسة؟

    أظهرت الدراسة وجود تنوع وراثي كبير بين عينات المعز السوري، حيث تراوح عدد الأليلات لكل موقع جيني من 3 إلى 8 أليلات، وتفاوتت نسبة تكرار الأليلات بين المواقع الجينية المختلفة.


References used
Aljumaah, R.S.; M.M. Musthafa; M.A. Al-Shaikh; O.M. Badri; and M.F. Hussein (2012). Genetic diversity of Ardi goat based on microsatellite analysis. African Journal of Biotechnology. 11(100):16539-16545
Arevalo, E.; D.A. Holder; J.N. Derr; E. Bhebhe; R.A. Linn; F. Ruvuna; S.K. Davis; and J.F. Taylor (1994). Caprine microsatellite dinucleotide repeat polymorphisms at the SR‐CRSP‐1, SR‐CRSP‐2, SR‐CRSP‐3, SR‐CRSP‐41 and SR‐CRSP‐5 loci. Animal genetics. 25(3):202-202
Bhebhe, E.; J. Kogi; D.A. Holder; E. Arevalo; J.N. Derr; R.A. Linn; F. Ruvuna; S.K. Davis; and J.F. Taylor (1994). Caprine microsatellite dinucleotide repeat polymorphisms at the SR‐CRSP‐6, SR‐CRSP‐7, SR‐CRSP‐8, SR‐CRSP‐9 and SR‐CRSP‐10 loci. Animal genetics. 25(3):203-203
rate research

Read More

The research was executed in Biotechnology Lab (Faculty of Agriculture – Damascus University), during the season 2016. Sixteen genotypes of Sunflower Oil were planted to study the genetic diversity among these genotypes and to determine the degree of genetic Agreement using the technique SSR (Simple Sequence Repeats).
This research was carried out in the laboratories of the Atomic Energy Commission Molecular Biology and Biotechnology Department in Damascus to study the molecular characterization of five of local and introduced grapes varieties which collected f rom the Pome and Grapevine Research Center in Sweida using 20 primer pairs of SSR.
The objective of this study was to characterize and determine the genetic variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found that 154 alleles we re identified by using 26 primer pairs, and the proportion of the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were 0.58, 0.61, 0.31, respectively.
This research was carried out in molecular biology laboratory faculty of agriculture /Damascus University during the agriculture season 2015-2016, to study the genetic diversity and determine the degree of genetic similarity among eleven 11 cultiv ated vetch (Aleppo, Idleb, Kamishly, Hassekeh, Tartous, Lattakia, Homs, Hama, Sweida, Damascus,Daraa) by using the technique ISSR.
Seven plant samples were collected from some locations of Syrian juniper (Juniperus drupacea Labill.) in Syria for molecular characterization and to determine the genetic relationships between them using ISSR technique (Inter Simple Sequence Repea ts). Twenty three ISSR primers were used for this purpose, twelve primers showed polymorphism between studied samples and gave 89 bands, with polymorphism percentage of 95.5%. The band number resulted from each primer ranged between 4 bands for primers ISSR5 and ISSR9, and 12 bands for the primer ISSR1, with an average of 7.42 bands per primer. The minimum polymorphic percentage was 25% for primer ISSR9, and the maximum polymorphic percentage was 100% for the all primers except the primer ISSR9. The study showed correlation between the genetically converged samples and the collection sites (geographic correlation), the highest genetic relationship (93%) was within Latakia samples (Komat Alnabi Yonis – Jobet Bergal) and the lowest genetic relationship (42%) was between samples from Hamah (Jeb Alahmer) and Latakia (Almakamat) which refers to high genetic variation. The cluster analysis showed that the samples from nearby locations were gathered.
comments
Fetching comments Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
mircosoft-partner

هل ترغب بارسال اشعارات عن اخر التحديثات في شمرا-اكاديميا