Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new usermolecular characterization for Some Local and Introduced Grape Cultivars Vitis vinifera .L in Sweida Governorate Using SSR Technique
التوصيف الجزيئي لبعض أصناف العنب Vitis vinifera .L المحلية و المدخلة في محافظة السويداء باستخدام تقنية SSR
1323
1 96
0
(
0
)
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
نفذ البحث في مخابر هيئة الطاقة الذرية قسم البيولوجيا الجزيئية و التقانة الحيوية بدمشق, و تمت الدراسة على خمسة أصناف من العنب المحلية و المدخلة أخذت من مركز بحوث التفاحيات والكرمة في السويداء بهدف توصيفها جزيئياً و تحديد درجة القرابة الوراثية بينها, باستخدا تقنية ال SSR و استخدم لذلك 20 زوجاً من البادئات المتخصصة.
This research was carried out in the laboratories of the Atomic Energy Commission Molecular Biology and Biotechnology Department in Damascus to study the molecular characterization of five of local and introduced grapes varieties which collected from the Pome and Grapevine Research Center in Sweida using 20 primer pairs of SSR.
Artificial intelligence review:
Research summary
نُفذ البحث في مخابر هيئة الطاقة الذرية قسم البيولوجيا الجزيئية والتقانة الحيوية بدمشق، وتمت الدراسة على خمسة أصناف من العنب المحلية والمدخلة أُخذت من مركز بحوث التفاحيات والكرمة في السويداء بهدف توصيفها جزيئياً وتحديد درجة القرابة الوراثية بينها، باستخدام تقنية الـ SSR، واستخدم لذلك 20 زوجاً من البادئات المتخصصة. أظهرت تقنية SSR فعالية في التمييز بين أصناف العنب المدروسة، فقد استطاع (20 زوج) من البادئات تضخيم (36 أليل)، منها (24 أليل) متعدداً شكلياً بنسبة تعددية شكلية بلغت (66.7%). وزع التحليل العنقودي أصناف العنب المدروسة إلى ثلاث مجموعات ضمّت المجموعة الأولى الصنف المحلي زيني الذي أظهر أقل درجة قرابة وراثية مع بقية الأصناف المدروسة، وضمت المجموعة الثانية الصنف المدخل الفونس لاقالييه، في حين انقسمت المجموعة الثالثة إلى تحت مجموعتين ضمت تحت المجموعة الأولى الصنفين المحليين أسود قاري وأسود عادي، وضمت تحت المجموعة الثانية الصنف المدخل إيطاليا ممسك. يهدف البحث إلى التوصيف الجزيئي وتحديد درجة القرابة الوراثية بين خمسة أصناف من العنب المحلية والمدخلة في محافظة السويداء باستخدام تقنية الـ SSR. أظهرت النتائج أن تقنية SSR فعالة في التمييز بين أصناف العنب المدروسة، مما يساهم في تحديد درجة القرابة الوراثية بين الأصناف المدروسة واستخدامها في برامج التهجين واستنباط أصناف جديدة.
Critical review
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة خطوة مهمة في مجال التوصيف الجزيئي لأصناف العنب، حيث استخدمت تقنية الـ SSR التي أثبتت فعاليتها في التمييز بين الأصناف المختلفة. ومع ذلك، يمكن أن تكون هناك بعض النقاط التي تحتاج إلى تحسين. على سبيل المثال، كان من الممكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل عدد أكبر من الأصناف المحلية والمدخلة لتحسين دقة النتائج. كما أن الدراسة لم تتطرق بشكل كافٍ إلى تأثير العوامل البيئية على النتائج، وهو ما يمكن أن يكون له تأثير كبير على دقة التوصيف الجزيئي. بالإضافة إلى ذلك، كان من الممكن تقديم توصيات أكثر تفصيلاً حول كيفية استخدام هذه النتائج في برامج التهجين واستنباط أصناف جديدة.
Questions related to the research
-
ما هي التقنية المستخدمة في التوصيف الجزيئي لأصناف العنب في هذه الدراسة؟
تم استخدام تقنية التكرارات التسلسلية البسيطة (SSR) في التوصيف الجزيئي لأصناف العنب في هذه الدراسة.
-
كم عدد الأليلات التي تم تضخيمها باستخدام تقنية SSR في هذه الدراسة؟
تم تضخيم 36 أليل باستخدام تقنية SSR في هذه الدراسة.
-
ما هي نسبة التعددية الشكلية التي تم تحقيقها في هذه الدراسة؟
بلغت نسبة التعددية الشكلية 66.7% في هذه الدراسة.
-
كيف تم توزيع أصناف العنب المدروسة في التحليل العنقودي؟
تم توزيع أصناف العنب المدروسة إلى ثلاث مجموعات: المجموعة الأولى ضمت الصنف المحلي زيني، المجموعة الثانية ضمت الصنف المدخل الفونس لاقالييه، والمجموعة الثالثة انقسمت إلى تحت مجموعتين ضمت تحت المجموعة الأولى الصنفين المحليين أسود قاري وأسود عادي، وتحت المجموعة الثانية الصنف المدخل إيطاليا ممسك.
References used
Seyedi, A.; Esmaeili, A. and Mostafavi, M. (2013)." Study of stem type and different levels of IBA on rooting of Bougainvillea glabra". International Journal of Agriculture and Crop Sciences, 5(12): 1276−1279
Ricciardi, L.; Giorgio, V.; Giovanni, C. De.; Lotti, C.; Gallotta, A. and Fanizza, G.(2002). "The genetic of apulian apricot genotypes (Prunus armeniaca L.) assessed using AFLP markers". Cellular and Molecular Biology Letters.7:431-436
Semagn, K. ; Bjornstad, A. and Ndjiondjop, M.N. (2006). "An overview of molecular marker methods for plants". African Journal of Biotechnology. 25(5): 2540-2568
rate research
Read More
The research was executed in Biotechnology Lab (Faculty of
Agriculture – Damascus University), during the season 2016.
Sixteen genotypes of Sunflower Oil were planted to study the
genetic diversity among these genotypes and to determine the
degree of genetic Agreement using the technique SSR (Simple
Sequence Repeats).
The objective of this study was to characterize and determine the genetic
variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus
genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found
that 154 alleles we
re identified by using 26 primer pairs, and the proportion of
the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied
SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were
0.58, 0.61, 0.31, respectively.
20 local and introduced varieties of pear grown in Sweida during 2007 to
2010 were assessed in terms of flowering time, maturity time, accurate
morphological characterization for shoots, leaves, flowers and fruits and fruit
chemical analysis (tota
l soluble solids, total sugar and tetratable acidity) as well
as to determine firmness of fruit flesh and tree yield.
Results showed that flowering time was at mid April in most varieties, and
the varieties were divided into three groups according to their mature date:
early varieties maturated during July, mid varieties maturated during August
and late varieties maturated during September. However, A variety of
Conference was required artificial ripening.
The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats
around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to
harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic
divers
ity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including
Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study
was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using
7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of
4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3
alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the
genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic
sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527
genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.
Morphological and molecular characterization for six seedling genotypes of
Pistachio vera L (V1,V2,V3,V4,V5, and V6) in comparison with the most
commercial and wide spread varieties, Ashoury andWhite batoury was carried
out in Swaida province, sou
thern of Syria. Nuts chemical contents (dry
substance, moisture, total sugar and oil content) for both fresh and dry nuts
weight were also evaluated.
Seedling genotypes showed obvious differences toward the main diagnostic
traits, such as alternate bearing phenomena, the ratio of kernel weight to total
nut weight, split nuts percentage and loss percentage. Genotype V4 was
recognized by some important characters compared with the other genotypes
studied. Cluster analysis was assessed according to the existence or absence of
the most important studying morphological and agronomic indexes. All
genotypes studied and comparative cultivars were clustered into four groups.
RAPD technique was achieved using 25 randomly primers, 19 of which were
polymorphic with an average of polymorphism percentage of (66.47%). The
highest value of genetic similarity (0.81) was between Ashoury and V5
genotype, whereas the lowest value (0.56) was between V3 and V6. Cluster
analysis depending on RAPD data divided the population studied into two main
groups. RAPD unique band was estimated (37 unique band, 21 positive and 16
negative).
It was concluded that RAPD technique can be used efficiently to emphasize,
identify, insure and evaluate the genetic diversity of Pistachio vera.
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
