Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new userMolecular characterization of some almond cultivars and rootstocks in Syria using SSR markers
التوصيف الجزيئي لبعض أصناف و أصول اللوز في سورية باستخدام المؤشرات الـ SSRs
1560
0 12
0
(
0
)
Added by
Damascus University ورقة بحثية
Publication date
2014
fields
Groves
and research's language is
العربية
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
هدف البحث إلى توصيف التباينات الوراثية و تحديدها بين اثني عشر صنفاً و أربعة أصول وراثية تتبع لجنس اللوز Amygdalus المنتشرة في سورية باستخدام تقنية المقاطع البـسيطة المتكـررة (SSRs)، استخدم 26 زوجا من البادئات و حدد 154 قرينا، و بلغت نـسبة القـرائن (alleles) المتخصـصة منهـا 52.30 ،% و تبين أن جميع المواقع الدقيقة المدروسة أظهرت تباينات بالقرائن التي كشفت ما بين الطـرز المدروسة، بلغ متوسط قيم كل من معامل PIC و الـ He و الـ Ho 58.0 و 61.0 و 31.0 ،على التوالي.
The objective of this study was to characterize and determine the genetic variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found that 154 alleles were identified by using 26 primer pairs, and the proportion of the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were 0.58, 0.61, 0.31, respectively.
Artificial intelligence review:
Research summary
هدفت هذه الدراسة إلى توصيف التباينات الوراثية بين اثني عشر صنفًا وأربعة أصول وراثية من اللوز المنتشرة في سوريا باستخدام تقنية المقاطع المتكررة البسيطة (SSRs). تم استخدام 26 زوجًا من البادئات لتحديد 154 قرينًا، وكانت نسبة القرائن المتخصصة منها 30.52%. أظهرت جميع المواقع المدروسة تباينات وراثية، حيث بلغ متوسط قيم معامل التعددية الشكلية (PIC) والتغاير الوراثي المتوقع (He) والتغاير الوراثي الملحوظ (Ho) 0.58 و0.61 و0.31 على التوالي. تم تنظيم الأصناف والأصول المدروسة في ثلاث مجموعات باستخدام التحليل العنقودي، حيث ضمت المجموعتان الأولى والثانية أصناف اللوز المحلية والأجنبية معًا، بينما شملت المجموعة الثالثة جميع الأصول المدروسة. ارتبط توزيع الأصناف والأصول ضمن المجموعات بتوزيع مجموعة من القرائن الناتجة عن ثلاثة مواقع توابع دقيقة.
أظهرت النتائج أن تقنية SSR فعالة في توصيف وتوثيق أصناف وأصول اللوز، وأوصت الدراسة باستخدام البادئات التي أظهرت تباينات واضحة بين الأصناف والأصول. كما أوصت باستخدام بادئات أخرى للتوسع في دراسة التنوع الوراثي وتحديد مؤشرات مرتبطة بصفات مرغوبة.
Critical review
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة خطوة مهمة في مجال التوصيف الجزيئي لأصناف وأصول اللوز في سوريا، حيث استخدمت تقنيات حديثة لتحديد التباينات الوراثية. ومع ذلك، يمكن الإشارة إلى بعض النقاط التي قد تحتاج إلى تحسين. أولاً، كان من الممكن زيادة عدد العينات المدروسة للحصول على نتائج أكثر دقة وشمولية. ثانيًا، يمكن توسيع نطاق الدراسة ليشمل مناطق جغرافية أخرى في سوريا أو حتى دول مجاورة للحصول على صورة أوسع للتنوع الوراثي. وأخيرًا، كان من الممكن تقديم تحليل أعمق للنتائج وربطها بتطبيقات عملية في مجالات الزراعة وتحسين الأصناف.
Questions related to the research
-
ما هو الهدف الرئيسي من الدراسة؟
الهدف الرئيسي من الدراسة هو توصيف التباينات الوراثية بين أصناف وأصول اللوز في سوريا باستخدام تقنية المقاطع المتكررة البسيطة (SSRs).
-
كم عدد القرائن التي تم تحديدها في الدراسة؟
تم تحديد 154 قرينًا باستخدام 26 زوجًا من البادئات.
-
ما هي نسبة القرائن المتخصصة التي تم تحديدها؟
كانت نسبة القرائن المتخصصة 30.52% من العدد الكلي للقرائن الناتجة.
-
كيف تم تنظيم الأصناف والأصول المدروسة في الدراسة؟
تم تنظيم الأصناف والأصول المدروسة في ثلاث مجموعات باستخدام التحليل العنقودي، حيث ضمت المجموعتان الأولى والثانية أصناف اللوز المحلية والأجنبية معًا، بينما شملت المجموعة الثالثة جميع الأصول المدروسة.
References used
Amirbakhtiar, N., B. H. Shiran. H. Moradi and B.E. Sayed-Tabatabaei. 2006. Molecular characterization of almond cultivars using microsatellite markers, ISHS. Acta. Horticulture. 726 :4
Aranzana, M. J, J. Garcia-Mas. J. Carbo and P. Aru`s. 2002. Development and variability analysis of microsatellite markers in peach, Plant Breed. 121(1):87-92
Botstein, D., L. Raymond and L. White.1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms, Am. J. Hum. Genet. 32: 314-331
rate research
Read More
This research was carried out in the laboratories of the Atomic
Energy Commission Molecular Biology and Biotechnology
Department in Damascus to study the molecular characterization of
five of local and introduced grapes varieties which collected f
rom
the Pome and Grapevine Research Center in Sweida using 20
primer pairs of SSR.
This investigation was carried out at the Laboratory of Biotechnology at
General Commission for Scientific Agricultural Research (GCSAR), during the
season 2010-2011. The aim of this research was to study the genetic diversity
among twenty individ
ual plants of seven species and to determine the degree of
genetic similarity using the technique ISSR (Inter Simple Sequence Repeats)
and 10 primers were used for this purpose. All primers proved their
effectiveness in showing polymorphism between the studied species, primers
gave a total 195 allele with a polymorphic percentage 100%. The number of
bands for each primer varied from a minimum of 12 bands for the primer
(ISSR-4) to a maximum of 27 bands for the primer (ISSR-862) in an average of
19.5 bands for each primer, cluster analysis and Dendrogram showed the
highest degree of genetic similarity between accession A.leucoclada1 and
A.leucoclada2 (0.64), while it was low between species A.leucoclada3 and
A.glauca2 (0.10). Results showed vast genetic diversity among the studied
species.
The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats
around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to
harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic
divers
ity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including
Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study
was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using
7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of
4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3
alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the
genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic
sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527
genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.
The research was executed in Biotechnology Lab (Faculty of
Agriculture – Damascus University), during the season 2016.
Sixteen genotypes of Sunflower Oil were planted to study the
genetic diversity among these genotypes and to determine the
degree of genetic Agreement using the technique SSR (Simple
Sequence Repeats).
Seven plant samples were collected from some locations of Syrian juniper
(Juniperus drupacea Labill.) in Syria for molecular characterization and to
determine the genetic relationships between them using ISSR technique (Inter
Simple Sequence Repea
ts). Twenty three ISSR primers were used for this
purpose, twelve primers showed polymorphism between studied samples and
gave 89 bands, with polymorphism percentage of 95.5%. The band number
resulted from each primer ranged between 4 bands for primers ISSR5 and
ISSR9, and 12 bands for the primer ISSR1, with an average of 7.42 bands per
primer. The minimum polymorphic percentage was 25% for primer ISSR9,
and the maximum polymorphic percentage was 100% for the all primers
except the primer ISSR9. The study showed correlation between the genetically
converged samples and the collection sites (geographic correlation), the highest
genetic relationship (93%) was within Latakia samples (Komat Alnabi Yonis –
Jobet Bergal) and the lowest genetic relationship (42%) was between samples
from Hamah (Jeb Alahmer) and Latakia (Almakamat) which refers to high
genetic variation. The cluster analysis showed that the samples from nearby
locations were gathered.
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
