Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new userMolecular Characterization of Juniperus drupacea Labill. (Syrian juniper) population in Syria Using ISSR Technique
التوصيف الجزيئي لطرز من العدريش Syrian juniper) Juniperus drupacea Labill) في سورية باستخدام مؤشرات الـ ISSR
1532
0 31
0
(
0
)
Added by
Damascus University ورقة بحثية
Publication date
2014
fields
Pharmacy
and research's language is
العربية
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
جمِعت 7 عينات نباتية من عدة مواقع لانتشار نبات العدريش .Labill drupacea Juniperus في سورية بهدف توصيفها جزيئياً و تحديد درجة القرابة الوراثيـة فيمـا بينهـا، باسـتخدام تقنيـة ISSR (Repeats Sequence Simple Inter) . و قد استخدم لهذا الغرض 23 بادئةً، أظهرت 12 بادئةً منهـا قدرتها على كشف تباينات و اختلافات بين العينات المدروسة، و نتج عن اسـتخدامها 89 حزمـة. و بلغـت نسبة هذه التعددية 5.95 % و تراوح عـدد الحـزم المكـاثرة لكـل بادئـة بـين 4 أربـع حـزم مـع البادئتين (ISSR9, ISSR5) و 12 حزمة مع البادئة (ISSR1) بمتوسط قدره 42.7 حزمةً/بادئة. و كانت النسبة المئوية للتعددية الشكلية الأقل مع البادئة (ISSR9) بمقـدار 25 % و الأكبـر مـع كـل البادئـات باستثناء (ISSR9) بمقدار 100% و بينت الدراسة ارتباط العينات المتقاربة وراثياً بالمناطق التي جمعـت منها (الموقع الجغرافي)، فقد كانت أعلى درجة قرابة وراثية (93) % بين عينات اللاذقيـة (قمـة النبـي يونس) و (جوبة برغال)، و أقل درجة قرابة وراثية (42) % بين عينات حمـاه (جـب الأحمـر) و اللاذقيـة (المقامات). و هذا يدل على وجود بعد وراثي عالٍ بينها. كما أن التحليل العنقودي فرز العينات التي جمعت من مناطق متقاربة جغرافياُ.
Seven plant samples were collected from some locations of Syrian juniper (Juniperus drupacea Labill.) in Syria for molecular characterization and to determine the genetic relationships between them using ISSR technique (Inter Simple Sequence Repeats). Twenty three ISSR primers were used for this purpose, twelve primers showed polymorphism between studied samples and gave 89 bands, with polymorphism percentage of 95.5%. The band number resulted from each primer ranged between 4 bands for primers ISSR5 and ISSR9, and 12 bands for the primer ISSR1, with an average of 7.42 bands per primer. The minimum polymorphic percentage was 25% for primer ISSR9, and the maximum polymorphic percentage was 100% for the all primers except the primer ISSR9. The study showed correlation between the genetically converged samples and the collection sites (geographic correlation), the highest genetic relationship (93%) was within Latakia samples (Komat Alnabi Yonis – Jobet Bergal) and the lowest genetic relationship (42%) was between samples from Hamah (Jeb Alahmer) and Latakia (Almakamat) which refers to high genetic variation. The cluster analysis showed that the samples from nearby locations were gathered.
Artificial intelligence review:
Research summary
تتناول هذه الدراسة التوصيف الجزيئي لسبع عينات من نبات العدريش (Juniperus drupacea Labill.) في سوريا باستخدام تقنية ISSR (Inter Simple Sequence Repeats). تم جمع العينات من مواقع مختلفة في محافظتي اللاذقية وحماه، وتم تحليلها باستخدام 23 بادئة ISSR. أظهرت النتائج أن 12 بادئة منها أظهرت تعددية شكلية بنسبة 95.5%، حيث تم الحصول على 89 حزمة من الحمض النووي DNA. أظهرت الدراسة وجود ارتباط جيني بين العينات المتقاربة جغرافياً، حيث كانت أعلى درجة قرابة جينية (93%) بين عينات اللاذقية (قمة النبي يونس وجوبة برغال)، وأقل درجة قرابة جينية (42%) بين عينات حماه (جب الأحمر) واللاذقية (المقامات). تم تحليل العينات باستخدام التحليل العنقودي، والذي أظهر تجمع العينات من نفس المواقع الجغرافية في مجموعات متقاربة. تهدف الدراسة إلى الحفاظ على التنوع الحيوي الوراثي لنبات العدريش في سوريا من خلال التوصيف الجزيئي للطرز الوراثية المختلفة.
Critical review
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة خطوة هامة نحو فهم التنوع الوراثي لنبات العدريش في سوريا، إلا أن هناك بعض النقاط التي يمكن تحسينها. أولاً، كان من الأفضل توسيع نطاق العينات لتشمل مناطق أخرى في سوريا لضمان تمثيل أكبر للتنوع الوراثي. ثانياً، يمكن تعزيز الدراسة بإضافة تحليلات أخرى مثل SSR أو AFLP لتقديم صورة أكثر شمولية عن التنوع الوراثي. ثالثاً، لم يتم التطرق بشكل كافٍ إلى التطبيقات العملية لهذه النتائج في مجالات مثل الزراعة أو الحفاظ على البيئة، مما يمكن أن يعزز من قيمة الدراسة.
Questions related to the research
-
ما هو الهدف الرئيسي من الدراسة؟
الهدف الرئيسي من الدراسة هو التوصيف الجزيئي لسبع طرز من نبات العدريش لتحديد بصمتها الوراثية ودرجة القرابة الوراثية فيما بينها باستخدام مؤشرات ISSR.
-
ما هي التقنية المستخدمة في الدراسة لتحديد التنوع الوراثي؟
التقنية المستخدمة هي تقنية ISSR (Inter Simple Sequence Repeats).
-
ما هي أعلى نسبة قرابة جينية تم العثور عليها بين العينات؟
أعلى نسبة قرابة جينية كانت 93% بين عينات اللاذقية (قمة النبي يونس وجوبة برغال).
-
ما هي التوصيات المستقبلية التي قدمتها الدراسة؟
توصي الدراسة بتحديد الصفات الكمية المسؤولة عن الطرز الوراثية للظروف البيئية المختلفة ومقارنتها مع الطرز القريبة منها وراثياً، والعمل على إكثار الطرز المتحملة للإجهادات البيئية.
References used
Adams, R. and T. Demeke. 1993. Systematic relationships in Juniperus based on DNAs (RAPDs). Taxon, 42(3): 553-571
Adams, R., A. Schwarzbach and R. Pandey. 2003. The concordance of terpenoid, ISSR and RAPD markers and ITS sequence data sets among genotypes: an example from Juniperus, Biochemical Systematics and Ecology, 31: 375–387
Bornet, B., F. Goraguer, G. Joly and M. Branchard. 2002. Genetic diversity in European and Argentinian cultivated potatoes (Solanum tuberosum subsp. tuberosum) detected by inter-simple sequence repeats (ISSRs), Genome, 45: 481-484
rate research
Read More
This research was carried out in molecular biology laboratory
faculty of agriculture /Damascus University during the agriculture
season 2015-2016, to study the genetic diversity and determine the
degree of genetic similarity among eleven 11 cultiv
ated vetch
(Aleppo, Idleb, Kamishly, Hassekeh, Tartous, Lattakia, Homs,
Hama, Sweida, Damascus,Daraa) by using the technique ISSR.
The objective of this study was to characterize and determine the genetic
variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus
genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found
that 154 alleles we
re identified by using 26 primer pairs, and the proportion of
the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied
SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were
0.58, 0.61, 0.31, respectively.
The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats
around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to
harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic
divers
ity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including
Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study
was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using
7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of
4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3
alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the
genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic
sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527
genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.
This investigation was carried out at the Laboratory of Biotechnology at
General Commission for Scientific Agricultural Research (GCSAR), during the
season 2010-2011. The aim of this research was to study the genetic diversity
among twenty individ
ual plants of seven species and to determine the degree of
genetic similarity using the technique ISSR (Inter Simple Sequence Repeats)
and 10 primers were used for this purpose. All primers proved their
effectiveness in showing polymorphism between the studied species, primers
gave a total 195 allele with a polymorphic percentage 100%. The number of
bands for each primer varied from a minimum of 12 bands for the primer
(ISSR-4) to a maximum of 27 bands for the primer (ISSR-862) in an average of
19.5 bands for each primer, cluster analysis and Dendrogram showed the
highest degree of genetic similarity between accession A.leucoclada1 and
A.leucoclada2 (0.64), while it was low between species A.leucoclada3 and
A.glauca2 (0.10). Results showed vast genetic diversity among the studied
species.
Ephedra is a dioecious, drought- and frost-resistant, perennial, evergreen shrub
with high medicinal value due to its content of ephedrine alkaloids. It became quite clear throughout
referential studies that this significant medical plant which is spontaneously widespread in Syria and there
have been an increased international demand on it hasn’t been studied yet.
suggested questions
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
