Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new userMolecular Characterization and Genetic Relatedness Between some Accessions of Origanum syriacum in Syria Using RAPD Technique
التوصيف الجزيئي و درجة القرابة بين بعض الطرز البرية لنبات الأوريعانوم Origanum syriacum في سورية باستخدام تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا RAPD
1433
0 51
0
(
0
)
Added by
Aِl-Baath University ورقة بحثية
Publication date
2015
fields
Agricultural Engineering
and research's language is
العربية
Authors
راما عزيز( باحث )
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
استخدمت تقانة الدنا المضخم عشوائيا RAPD للحصول على معلومات عن درجة القرابة بين 10 طرز برية من نباتات الأوريغام Origanum syriacum في سوريا. إن لنتائج هذه الدراسة أهمية كبيرة في مجال دراسات التنوع الحيوي في القطر الذي يعوزه استخدام التقانات على المستوى الجزئي و نوصي بالاستفادة من هذه التقانات في توصيف الطرز الوراثية بشكل عام و دراسة علاقات القربى فيما بينها, و بشكل خاص في دراسة الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف في القطر على المستوى الجزئي.
Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used to study the genetic relationship among 10 wild accessions of Origanum syriacum grown in Syria. The results of this study may have a great impact on the national biodiversity program which lacks the employment of molecular techniques, and thus we recommend making use of these techniques in genotype identification in general, and studying the relationship among them, and in particular in studying important wild species of medical importance which have not been described yet on the molecular level.
Artificial intelligence review:
Research summary
تتناول الدراسة التوصيف الجزيئي ودرجة القرابة بين بعض الطرز البرية لنبات الأوريغانوم Origanum syriacum في سوريا باستخدام تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا (RAPD). استخدمت الدراسة 27 مرئسة عشوائية لتحليل 10 طرز برية من هذا النبات. أظهرت النتائج وجود تعددية شكلية بين الطرز المدروسة، وتمكنت من تحديد درجة القرابة الوراثية بينها بناءً على المواقع الجغرافية. أظهرت النتائج أن الطرز من نفس المنطقة الجغرافية تميل إلى التجمع معًا في عناقيد مستقلة. أثبتت الدراسة فعالية تقانة RAPD في تحديد البصمة الوراثية للأوريغانوم وكشف درجة القرابة بين الطرز المدروسة. توصي الدراسة باستخدام هذه التقانة في توصيف الطرز الوراثية ودراسة علاقات القربى بين الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي في سوريا.
Critical review
دراسة نقدية: الدراسة تقدم مساهمة قيمة في مجال التنوع الحيوي وتحديد العلاقات الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم في سوريا. ومع ذلك، يمكن الإشارة إلى بعض النقاط التي قد تحتاج إلى تحسين. أولاً، الاعتماد على تقانة RAPD فقط قد يكون محدودًا بسبب انخفاض إمكانية الإعادة وصعوبة مقارنة النتائج بين المخابر المختلفة. قد يكون من الأفضل استخدام تقانات إضافية مثل SSR أو AFLP لتعزيز دقة النتائج. ثانيًا، الدراسة لم تتناول بشكل كافٍ تأثير العوامل البيئية الأخرى التي قد تؤثر على التباين الوراثي. وأخيرًا، يمكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل عددًا أكبر من الطرز والمناطق الجغرافية للحصول على صورة أكثر شمولية عن التنوع الوراثي لنبات الأوريغانوم في سوريا.
Questions related to the research
-
ما هي التقنية المستخدمة في الدراسة لتحديد درجة القرابة الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم؟
استخدمت الدراسة تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا (RAPD) لتحديد درجة القرابة الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم.
-
ما هي أهمية نتائج هذه الدراسة في مجال التنوع الحيوي في سوريا؟
نتائج هذه الدراسة مهمة لأنها تسهم في توصيف الطرز الوراثية ودراسة علاقات القربى بين الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي في سوريا، مما يعزز من جهود الحفاظ على التنوع الحيوي.
-
ما هي العلاقة بين درجة القرابة الوراثية والمواقع الجغرافية للطرز المدروسة؟
أظهرت النتائج أن الطرز من نفس المنطقة الجغرافية تميل إلى التجمع معًا في عناقيد مستقلة، مما يشير إلى وجود علاقة قوية بين درجة القرابة الوراثية والمواقع الجغرافية.
-
ما هي التوصيات التي قدمتها الدراسة للاستفادة من تقانة RAPD؟
توصي الدراسة بالاستفادة من تقانة RAPD في توصيف الطرز الوراثية بشكل عام ودراسة علاقات القربى بينها، وخاصة في دراسة الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي.
References used
ODEH, A; DEWIK, H; QABAJAH, M; IMAM, A; DEMBITTSKY, M; HANUS, L 2007- Natural compounds of Palestine flora, Biomed. Pap. Vol.151: 21-29
ODEH, A; DEWIK, H; QABAJAH, M; IMAM, A; DEMBITTSKY, M; HANUS, L 2008- Thymol and carvacrol production from leaves of wild Palestinian Origanum syriacum. Bioresour. Technol.,Vol. 99: 3914-3918
ASLIM, B; YUCEL, N 2008- In vitro antimicrobial activity of essential oil from endemic Origanum minutiflorum on ciprofloxacin-resistant Campylobacter spp. Food Chem., Vol. 107: 602-606
rate research
Read More
This research was carried out in molecular biology laboratory
faculty of agriculture /Damascus University during the agriculture
season 2015-2016, to study the genetic diversity and determine the
degree of genetic similarity among eleven 11 cultiv
ated vetch
(Aleppo, Idleb, Kamishly, Hassekeh, Tartous, Lattakia, Homs,
Hama, Sweida, Damascus,Daraa) by using the technique ISSR.
This research was conducted to detect the morphological and molecular
differences between golden henbane (Hyoscyamus aureus L) collected from
south Syria. Seeds were collected from six locations, then sterilized and grown
In Vitro. Grown plants we
re described for some morphological characters. The
molecular characterization was carried out using the method of Inter Simple
Sequence Repeats (ISSR) to detect genetic variations. The plants showed
significant (p<0.01) morphological differences among studied locations, Plant
height ranged from 14.97 to 18.97 cm and stem color ranged from red to green.
Trichome density also ranged between medium, high and very high.
Furthermore, significant differences in leaves dimensions were observed
according to the plant geographical location. The main root length ranged from
6.09 to 8.37 cm. Molecular analysis by ISSR produced a total of 56 bands, 49 of
which were polymorphic (87.5%), resulted from using 11 non-specific primers.
A genetic distance dendrogram was drawn. based on the results of genetic
characterization of plant from different locations. The plants collected from
Salkhad separated with a genetic distance of 0.312 while the plants collected
from other locations were grouped together, at the same time, they were
divided into two sub groups, the first group comprised plants collected from
Qalamoun and Dimas regions with a genetic distance of 0.032, whereas sub
group II content Bosra plants which separated clearly from those of Dara' dam
and Wadi Al-Zaidi by a genetic distance of 0.017, These results may indicate a
relationship between genetic characters of this plant species with geographic
distribution.
The objective of this study was to characterize and determine the genetic
variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus
genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found
that 154 alleles we
re identified by using 26 primer pairs, and the proportion of
the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied
SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were
0.58, 0.61, 0.31, respectively.
The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats
around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to
harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic
divers
ity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including
Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study
was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using
7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of
4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3
alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the
genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic
sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527
genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.
This investigation was carried out at the Laboratory of Biotechnology at
General Commission for Scientific Agricultural Research (GCSAR), during the
season 2010-2011. The aim of this research was to study the genetic diversity
among twenty individ
ual plants of seven species and to determine the degree of
genetic similarity using the technique ISSR (Inter Simple Sequence Repeats)
and 10 primers were used for this purpose. All primers proved their
effectiveness in showing polymorphism between the studied species, primers
gave a total 195 allele with a polymorphic percentage 100%. The number of
bands for each primer varied from a minimum of 12 bands for the primer
(ISSR-4) to a maximum of 27 bands for the primer (ISSR-862) in an average of
19.5 bands for each primer, cluster analysis and Dendrogram showed the
highest degree of genetic similarity between accession A.leucoclada1 and
A.leucoclada2 (0.64), while it was low between species A.leucoclada3 and
A.glauca2 (0.10). Results showed vast genetic diversity among the studied
species.
suggested questions
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
