Do you want to publish a course? Click here

Molecular Characterization and Genetic Relatedness Between some Accessions of Origanum syriacum in Syria Using RAPD Technique

التوصيف الجزيئي و درجة القرابة بين بعض الطرز البرية لنبات الأوريعانوم Origanum syriacum في سورية باستخدام تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا RAPD

1419   0   51   0 ( 0 )
 Publication date 2015
and research's language is العربية
 Created by Shamra Editor




Ask ChatGPT about the research

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used to study the genetic relationship among 10 wild accessions of Origanum syriacum grown in Syria. The results of this study may have a great impact on the national biodiversity program which lacks the employment of molecular techniques, and thus we recommend making use of these techniques in genotype identification in general, and studying the relationship among them, and in particular in studying important wild species of medical importance which have not been described yet on the molecular level.


Artificial intelligence review:
Research summary
تتناول الدراسة التوصيف الجزيئي ودرجة القرابة بين بعض الطرز البرية لنبات الأوريغانوم Origanum syriacum في سوريا باستخدام تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا (RAPD). استخدمت الدراسة 27 مرئسة عشوائية لتحليل 10 طرز برية من هذا النبات. أظهرت النتائج وجود تعددية شكلية بين الطرز المدروسة، وتمكنت من تحديد درجة القرابة الوراثية بينها بناءً على المواقع الجغرافية. أظهرت النتائج أن الطرز من نفس المنطقة الجغرافية تميل إلى التجمع معًا في عناقيد مستقلة. أثبتت الدراسة فعالية تقانة RAPD في تحديد البصمة الوراثية للأوريغانوم وكشف درجة القرابة بين الطرز المدروسة. توصي الدراسة باستخدام هذه التقانة في توصيف الطرز الوراثية ودراسة علاقات القربى بين الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي في سوريا.
Critical review
دراسة نقدية: الدراسة تقدم مساهمة قيمة في مجال التنوع الحيوي وتحديد العلاقات الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم في سوريا. ومع ذلك، يمكن الإشارة إلى بعض النقاط التي قد تحتاج إلى تحسين. أولاً، الاعتماد على تقانة RAPD فقط قد يكون محدودًا بسبب انخفاض إمكانية الإعادة وصعوبة مقارنة النتائج بين المخابر المختلفة. قد يكون من الأفضل استخدام تقانات إضافية مثل SSR أو AFLP لتعزيز دقة النتائج. ثانيًا، الدراسة لم تتناول بشكل كافٍ تأثير العوامل البيئية الأخرى التي قد تؤثر على التباين الوراثي. وأخيرًا، يمكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل عددًا أكبر من الطرز والمناطق الجغرافية للحصول على صورة أكثر شمولية عن التنوع الوراثي لنبات الأوريغانوم في سوريا.
Questions related to the research
  1. ما هي التقنية المستخدمة في الدراسة لتحديد درجة القرابة الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم؟

    استخدمت الدراسة تقانة التضخيم العشوائي متعدد الأشكال للدنا (RAPD) لتحديد درجة القرابة الوراثية بين الطرز البرية لنبات الأوريغانوم.

  2. ما هي أهمية نتائج هذه الدراسة في مجال التنوع الحيوي في سوريا؟

    نتائج هذه الدراسة مهمة لأنها تسهم في توصيف الطرز الوراثية ودراسة علاقات القربى بين الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي في سوريا، مما يعزز من جهود الحفاظ على التنوع الحيوي.

  3. ما هي العلاقة بين درجة القرابة الوراثية والمواقع الجغرافية للطرز المدروسة؟

    أظهرت النتائج أن الطرز من نفس المنطقة الجغرافية تميل إلى التجمع معًا في عناقيد مستقلة، مما يشير إلى وجود علاقة قوية بين درجة القرابة الوراثية والمواقع الجغرافية.

  4. ما هي التوصيات التي قدمتها الدراسة للاستفادة من تقانة RAPD؟

    توصي الدراسة بالاستفادة من تقانة RAPD في توصيف الطرز الوراثية بشكل عام ودراسة علاقات القربى بينها، وخاصة في دراسة الأنواع الطبية البرية المهمة التي لم توصف بعد على المستوى الجزيئي.


References used
ODEH, A; DEWIK, H; QABAJAH, M; IMAM, A; DEMBITTSKY, M; HANUS, L 2007- Natural compounds of Palestine flora, Biomed. Pap. Vol.151: 21-29
ODEH, A; DEWIK, H; QABAJAH, M; IMAM, A; DEMBITTSKY, M; HANUS, L 2008- Thymol and carvacrol production from leaves of wild Palestinian Origanum syriacum. Bioresour. Technol.,Vol. 99: 3914-3918
ASLIM, B; YUCEL, N 2008- In vitro antimicrobial activity of essential oil from endemic Origanum minutiflorum on ciprofloxacin-resistant Campylobacter spp. Food Chem., Vol. 107: 602-606
rate research

Read More

This research was carried out in molecular biology laboratory faculty of agriculture /Damascus University during the agriculture season 2015-2016, to study the genetic diversity and determine the degree of genetic similarity among eleven 11 cultiv ated vetch (Aleppo, Idleb, Kamishly, Hassekeh, Tartous, Lattakia, Homs, Hama, Sweida, Damascus,Daraa) by using the technique ISSR.
This research was conducted to detect the morphological and molecular differences between golden henbane (Hyoscyamus aureus L) collected from south Syria. Seeds were collected from six locations, then sterilized and grown In Vitro. Grown plants we re described for some morphological characters. The molecular characterization was carried out using the method of Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) to detect genetic variations. The plants showed significant (p<0.01) morphological differences among studied locations, Plant height ranged from 14.97 to 18.97 cm and stem color ranged from red to green. Trichome density also ranged between medium, high and very high. Furthermore, significant differences in leaves dimensions were observed according to the plant geographical location. The main root length ranged from 6.09 to 8.37 cm. Molecular analysis by ISSR produced a total of 56 bands, 49 of which were polymorphic (87.5%), resulted from using 11 non-specific primers. A genetic distance dendrogram was drawn. based on the results of genetic characterization of plant from different locations. The plants collected from Salkhad separated with a genetic distance of 0.312 while the plants collected from other locations were grouped together, at the same time, they were divided into two sub groups, the first group comprised plants collected from Qalamoun and Dimas regions with a genetic distance of 0.032, whereas sub group II content Bosra plants which separated clearly from those of Dara' dam and Wadi Al-Zaidi by a genetic distance of 0.017, These results may indicate a relationship between genetic characters of this plant species with geographic distribution.
The objective of this study was to characterize and determine the genetic variation among twelve cultivars and four rootstocks, belonging to Amygdalus genus in Syria using the simple sequence repeats (SSRs) marker. It was found that 154 alleles we re identified by using 26 primer pairs, and the proportion of the specific ones was 30.52%. In addition, it was revealed that all the studied SSR loci produced polymorphic alleles. The average of PIC, He and Ho were 0.58, 0.61, 0.31, respectively.
The wide geographical spread and the exponential growth of the numbers of goats around the world clearly demonstrate the ability of these ruminants to adapt to harsh climates and grazing land. The aim of this study was to assess the genetic divers ity of 42 samples of Syrian goats from many domestication stations including Jabali, Shami and hybrid (hybridization between both Shami and Jabali). The study was done by DNA extraction of these samples, application of SSR technology using 7 microstellite markers. The alleles number of markers were 29 alleles, at a rate of 4.1 allele for each genetic locus. The number of alleles of each locus ranged from 3 alleles in genetically markers (BMS1714, INRAD07, SRCRSP09) to 8 alleles at the genetic marker SRCRSP01. The rate of allele-frequency across all studied genetic sites ranged from 0.071429 with the molecular size of 210 bp for the McM527 genetic site to 0.97619 with a molecular size of 55 bp for the SRCRSP09 genetic site.
This investigation was carried out at the Laboratory of Biotechnology at General Commission for Scientific Agricultural Research (GCSAR), during the season 2010-2011. The aim of this research was to study the genetic diversity among twenty individ ual plants of seven species and to determine the degree of genetic similarity using the technique ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) and 10 primers were used for this purpose. All primers proved their effectiveness in showing polymorphism between the studied species, primers gave a total 195 allele with a polymorphic percentage 100%. The number of bands for each primer varied from a minimum of 12 bands for the primer (ISSR-4) to a maximum of 27 bands for the primer (ISSR-862) in an average of 19.5 bands for each primer, cluster analysis and Dendrogram showed the highest degree of genetic similarity between accession A.leucoclada1 and A.leucoclada2 (0.64), while it was low between species A.leucoclada3 and A.glauca2 (0.10). Results showed vast genetic diversity among the studied species.

suggested questions

comments
Fetching comments Fetching comments
mircosoft-partner

هل ترغب بارسال اشعارات عن اخر التحديثات في شمرا-اكاديميا