Do you want to publish a course? Click here

The genetic diversity in some syrian Hordeum vulgare L. genotypes using SSR markers

التنوع الوراثي لطرز من الشعير المزروع .L vulgare Hordeum في سورية باستخدام واسمات SSR

1818   2   10   0 ( 0 )
 Publication date 2014
and research's language is العربية
 Created by Shamra Editor




Ask ChatGPT about the research

The research aimed to evaluate the genetic diversity and the genetic relationship between 16 Hordeum vulgare genotypes (variaties and new lines), using SSR markers. 32 primer pairs were used in the analysis, five of them amplified primers monomorphic alleles, while the remaining primers detected different alleles. A total of 126 polymorphic alleles were revealed by the 27 primer pairs. The number of different alleles detected on alocus ranged from 2 to 11with a mean of 4.66 alleles per locus. The polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.21 to 0.88 with a mean value of 0.49, and the gene diversity ranged from 0.23 to 0.89 with a mean value of 0.53.The dendrogram was established using SSR data clustered into three major groups. The smallest genetic relationship was observed between line39 and line38 . The results proved the efficiency of SSR markers in the estimation of genetic diversity and in the clustering of the barley genotypes in Syria.


Artificial intelligence review:
Research summary
هدفت الدراسة إلى تقييم التنوع الوراثي ودراسة درجة القرابة الوراثية بين 16 طرازًا وراثيًا من الشعير المزروع (Hordeum vulgare L) باستخدام مؤشرات SSR. تم استخدام 32 زوجًا من بادئات المقاطع القصيرة المتكررة SSR، حيث تبين أن 5 منها لم تعط تعددية شكلية، بينما استخدم الـ27 زوجًا المتبقية في تقييم التنوع الوراثي. أنتجت هذه البادئات ما مجموعه 126 قرينًا بمعدل 4.66 قرينًا لكل موقع وراثي، وتراوحت عدد القرائن لكل موقع وراثي بين قرينين و11 قرينًا. تراوحت قيمة معامل التعددية الشكلية (PIC) بين 0.21 و0.88، وكانت أكثر البادئات قدرة على التمييز بين الطرز الوراثية هي scssr07970 وBmag0125 وscssr10148. توزعت الطرز المدروسة في شجرة القرابة الوراثية إلى ثلاثة عناقيد، وأظهرت مؤشرات SSR قدرة عالية على التمييز بين الطرز الوراثية المدروسة من الشعير. توصلت الدراسة إلى أن مؤشرات SSR فعالة في الكشف عن التباينات الوراثية وتحديد العلاقات الوراثية بين الطرز المختلفة، مما يساعد في برامج تربية الشعير واختيار الأباء المناسبة للتهجين.
Critical review
دراسة نقدية: تُعد الدراسة مهمة في مجال تحسين المحاصيل الزراعية وتحديد التنوع الوراثي للشعير في سوريا. ومع ذلك، كان من الممكن تعزيز الدراسة بمزيد من العينات من مناطق جغرافية مختلفة لزيادة دقة النتائج. كما أن استخدام تقنيات جزيئية أخرى مثل AFLP أو ISSR قد يضيف مزيدًا من العمق للفهم الوراثي. بالإضافة إلى ذلك، كان من الممكن تقديم تحليل أعمق للبيانات الوراثية وربطها بالصفات الفينوتيبية للنباتات المدروسة. بشكل عام، الدراسة قدمت نتائج قيمة ولكن يمكن تحسينها بمزيد من التحليل والتوسع في نطاق البحث.
Questions related to the research
  1. ما الهدف الرئيسي من الدراسة؟

    الهدف الرئيسي من الدراسة هو تقييم التنوع الوراثي ودراسة درجة القرابة الوراثية بين 16 طرازًا وراثيًا من الشعير المزروع في سوريا باستخدام مؤشرات SSR.

  2. كم عدد البادئات المستخدمة في الدراسة؟

    تم استخدام 32 زوجًا من بادئات المقاطع القصيرة المتكررة SSR في الدراسة.

  3. ما هي أعلى قيمة لمعامل التعددية الشكلية (PIC) التي تم العثور عليها؟

    أعلى قيمة لمعامل التعددية الشكلية (PIC) التي تم العثور عليها كانت 0.88.

  4. كيف توزعت الطرز الوراثية المدروسة في شجرة القرابة الوراثية؟

    توزعت الطرز الوراثية المدروسة في شجرة القرابة الوراثية إلى ثلاثة عناقيد رئيسية.


References used
Abebe, TD. 2010. Genetic diversity and population differentiation analysis of ethiopian barley (Hordeum vulgare L) landraces using morphological traits and SSR markers. PhD thesis. Institut für Nutzpflanzenwissenschaften und Ressourcenschutz
Baum, M.. S. Grando and S. Ceccarelli. 2004. Localization of quantitative trait loci for dryland characters in barley by linkage mapping. Crop Science Society of America and American Society of Agronomy, 677 S. Segoe Rd., Madison, WI 53711, USA. Challenges and Strategies for Dryland Agriculture. CSSA Special Publication no. 32
Becker, J. and M. Heun. 1995. Barley microsatellites allele variation and mapping, Plant Mol. Biol. 27:835-845
rate research

Read More

A half diallel set of crosses among six highly diverse barley (Hordeum vulgare L.) genotypes were evaluated at Karahta station of field crops research (GCSAR) Damascus Governorate, during 2010-2011 and 2011-2012 seasons to study heterosis and comb ining ability components for plant height, grain yield per plant, number of spikes per plant, number of grains per spike and thousand kernel weight.
This study present first estimates of segregation distortion as revealed by comparison of segregation ratios in DH lines and sexually produced F٢ lines in barley using the co-dominant microsatellite markers (STMS).
This cultivation was carried out in the farm of the Faculty of Agriculture at Damascus University during the 2013-2014 agricultural season to study the effect of seeding rate per unit area and planting dates on yield and its components for three barley genotypes under rain-fed conditions.
The research was executed in Biotechnology Lab (Faculty of Agriculture – Damascus University), during the season 2016. Sixteen genotypes of Sunflower Oil were planted to study the genetic diversity among these genotypes and to determine the degree of genetic Agreement using the technique SSR (Simple Sequence Repeats).
The research was carried out in the biotechnology Laboratory at the Faculty of Agriculture, Damascus University, in cooperation with the General Commission For Scientific Agricultural Research (GCSAR), during the year 2012. Eleven genotypes of cul tivated chickpea were planted to determine their genetic diversity and the degree of genetic similarity using the ISSR technique. 16 primers were used for this purpose. Results indicated that Nine primers proved their effectiveness in showing polymorphism among the genotypes examined and the primers gave a total of 91 alleles with a polymorphic percentage of 93.4%. The number of bands for each primer varied from a minimum of 2 bands for the primers ISSR7-ISSR13 to a maximum of 16 bands for the primer ISSR11, with an average of 9.1 bands per a primer. The results also showed that the degree of genetic similarity ranged between 46 and 78%, where the highest was 78% between the genotypes of Afghanistan – Morocco, then 77% between the genotypes Tunisia-Afghanistan and Tunisia- Iran and followed by Spain- Iran and Spain- Pakistan (50%) and the lowest was 46% between genotypes Afghanistan- Pakistan.

suggested questions

comments
Fetching comments Fetching comments
mircosoft-partner

هل ترغب بارسال اشعارات عن اخر التحديثات في شمرا-اكاديميا