استخلاص الDNA المورثي من العينات صغيرة الحجم بطرق مختلفة و تقييم تركيزه و نقاوته

تم في هذه الدراسة استخلاص DNA من شرائح التجري المجهري عن الإصابة بداء الليشمانية. استخدمت ثلاث طرائق لاستخلاص DNA الأولى باستخدام محاليل ملحية جاهزة Promega Kit و الثانية تقليدية و الثالثة تعتمد استخدام أعمدة مزودة بأغشية من مادة سيليكاجيل طريقة Qia gen.

تقييم عدة طرائق لاستخلاص الDNA من نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروستات تابعة لجنس Begomovirus

قيمت في هذه الدراسة عدة طرائق لاستخلاص الدنا من أوراق نباتات الفليفلة للكشف عن الفيروسات التابعة للجنس Begomovirusُ, و ذلك بالاعتماد على كمية و نوعية دنا المستخلص بقياس تركيزه و نسبة امتصاصه للضوء باستخدام المطياف الضوئي.

مقايسة مستويات التعبير عن الجين الناقلة للميثيل DNMT3A لدى عيّنة من مرضى الابيضاض النّقوي الحاد AML السوريين

توجهت دراستنا نحو مقايسة مستويات التعبير عن الجين الناقلة للميثيل DNMT3A عند جمهرة من مرضى ابيضاض دم نقوي حاد سوريين و مقارنتها مع مستوياتها لدى الأصحّاء من جهة، و ربطها بأعمار المرضى و نمط الابيضاض من جهة ثانية. في محاولة لتوضيح دورها في آليّات نشوء الابيضاض و تطوّره.

دراسة 15 نظاماً من أنظمة التكرارات الترادفية القصيرة STRs لدى عينة من الشعب السوري

خلفية البحث و هدفه: درس 15 موضعاً مورثياً (نظاماً) من الموضوعات المورثية للتكرارات الترادفية القصيرة (STRs) على عينة من الشعب العربي السوري القاطنين في مدينة حلب. مواد البحث وطرائقه: درس 15 موضعاً مورثياً (نظاماً) من أنظمة التكرارات الترادفية القصيرة (STRs) على عينة من مجمل أطياف الشعب العربي السوري القاطنين في حلب، والمكونة من 127 شخصاً سليماً باستخدام كيتات من شركة Promega المكونة من مجموعة الأنظمة (D3S1358, TH01, D21S11, D18S51, PentaE, D5S818, D13S , 31.D7S820, D16S539, CSF1PO, PenyaD, vWA, D8S1179, T, POX , FGA). و استخرج ال DNA من العينات باستخدام كيت كياجين DNA Mini Kit بحسب التعليمات المرافقة للكيت، أجري التضخيم بتقانة ال PCR بجهاز الحرارة الدورية Thermocycler لشركة Applied Biosystems و الترحيل بجهاز الشركة ذاتها ABI PRISM 310 Genetic Analyzer ثم قرئت النتائج ببرنامج GeneMapper ID v3.0 software . أجري على العينات دراسة لمجموعة من المعايير الإحصائية الأساسية للأنظمة الخمسة عشر مثل حساب تخالفية اللواقح , و التعددية الشكلية PIC , و قوة التفريق PD وقوة الإقصاء PE ،و مؤشر الأبوة باستخدام برنامج إكسل –ويندو 2007 لشركة سوفت وير. وحسبت قيم الانحراف المعياري p-value للتأكد من خضوع التوزع المورثي للأنظمة المدروسة على العينة المنتقاة لتوازن هاردي وواينبرغ. النتائج: أظهرت دراستنا المقارنة بدراسات مشابهة لدى الشعب المغربي و التركي و العراقي فائدة الأنظمة المدروسة في التطبيقات الطبية الشرعية، و في تحديد هوية الأشخاص في سورية. الاستنتاج: فائدة الأنظمة المدروسة في التطبيقات الطبية الشرعية، و في تحديد هوية الأشخاص في سورية.

اكتشاف طفرتين في الإكسون 28 ضمن مورثة فون فيلبراند لدى مريضين راجعا مشفى هلم شاير الجامعي

اكتشفت طفرتان في الإكسون 28 من مورثة فون فيلبراند لدى رجل A و امرأة B مصابين بمرض فون فيلبراند. و قد أظهرت الاختبارات النوعية مثل مقايسة ارتباط VWF:FVIII و مقايسة ارتباط الكولاجن VWF:CB و تحليل بروتين العامل VWF أن مرض VWD هو من نمط 2A في المورثة. كما كشف تحري الإكسون 28 بواسطة تقنية PCR و سلسلة أسس الدنا DNA عن وجود الطفرة A1 (C>T) في المريض A و الطفرة B1 (G>A) في المريضة B و هي طفرات مسؤولة عن ظهور المرض VWD مما يؤكد على أن مورثات التخثر الطبيعية هي مورثات منظمة و مبرمجة ذاتياً.

دراسة التوصيف المورفولوجي و الجزيئي لأنواع الإفدرا الموجودة في سورية

تتميز شجيرة الإفدرا بأنها ثنائية الجنس، مقاومة للجفاف و الصقيع على حد سواء، معمرة، و ذات قيمة دوائية كبيرة لاحتوائها على قلويدات الإفدرين. تبين من خلال الدراسة المرجعية أنه لم تجرِ دراسة تفصيلية لهذا النبات الطبي المهم المنتشر طبيعياً في سورية الذي تزايد عليه الطلب عالمياً.

دراسة حساسية تقانة PCR Nested في كشف الرشاشية الدخناء في عينات قشع مخموجة تجريبي

تحتل الإصابات الفطرية المسببة بأنواع فطر الرشاشية Aspergillus عمومـاً، المرتبـة الثانيـة عالمياً بين الإصابات الفطرية الغازيـة، و بـشكل خـاص، تعـد الرشاشـية الـدخناء Aspergillus fumigatus المسبب الرئيسي لداء الرشاشيات الغازي (IA (Aspergillosis Invasive . و على الرغم من أن هذا الداء نادراً ما يصيب الأفراد سليمي المناعة، إلا أنه يؤدي إلى الوفاة لـدى الأشخاص المضعفين مناعياً، لذلك فمن الضروري تشخيصه بشكلٍ مبكر، لمعالجتـه بـشكلٍ نـاجع. إن الأدوات التشخيصية التقليدية المتبعة حالياً للكشف عن الإصابات هي الاستنبات على وسط سـابورو، إذ تتصف هذه الطريقة بأنها ذات حساسية منخفضة و موثوقية ضعيفة. و قد سمح لنا انتشار تقانة التفاعل السلـسلي للبـوليميراز PCR-Nested كتقانـة جزيئيـة ذات حساسية عالية، بإجراء دراسة مقارنة بين حساسية كلتا الطريقتين التقليدية المتبعة و PCR-Nested، 6 و أظهرت نتائج الدراسة على عينات قشع مخموجة تجريبياً بتراكيز مختلفـة راوحـت بـين 10 -10 بوغة/مل، حساسية تقانة PCR-Nested و نوعيتها في الكشف عن أدنى التراكيز، مقارنـة بطريقـة التشخيص التقليدية المتمثلة بالاستنبات الفطري على وسط سابورو التي كانت سلبية للتراكيز جميعها.

ستخدام تقنية PCR للكشف عن الليشمانيا المدارية في سورية

ينتشر داء الليشمانيا في ثمانٍ و ثمانين دولة من دول العالم و منها الجمهوريـة العربيـة الـسورية، و يسبب هذا الداء طفيلي وحيد خلية من أنواع جنس الليشمانيا، و ينتمي لهذا الجنس نحو اثنين و عشرين نوعاً ممرضاً للإنسان. يعرف للداء ثلاثة أشكال سريرية هي الداء الجلدي و الداء الجلدي المخاطي و الداء الحشوي. و قد طُورت مجموعة من طرائق التشخيص و تحديد نوع الطفيلي بهدف إعطاء العلاج المناسب، يتضمن التحليل الايزوانزيمي و الطرائق المصلية المناعية و تقانات تهجين DNA و لعل من أهم الطرائـق الجزيئية المعتمدة حالياً في تشخيص هذا الداء و معرفة نوع الطفيلي المسبب و أدقها هي تقنيـة التفاعـل السلسلي للبوليميراز PCR التي تعتمد إما على DNA الجينومي أو DNA الكينيتوبلاستي. قمنا في هذا العمل باستفراد نمطي DNA في خطوة واحدة من عزلات مأخوذة من أفراد مـصابين بـداء الليـشمانيا الجلدية و مستنبتة في المختبر. و اِستُخدم DNA الكينيتوبلاستي لتحديد نوع الطفيلـي باسـتخدام تقنيـة PCR؛ و ذلك بوجود مرئسات نوعية تضخم شدفاً ذات أطوال مختلفة مميزة لنوع الطفيلي. و قد حدد فـي هذه الدراسة نوع الطفيلي المسبب لداء الليشمانيا الجلدية عند هـؤلاء المـصابين، و تبـين أن العـزلات المدروسة جميعها هي من نوع الليشمانيا المدارية tropica. L.

دراسة التنوع الوراثي لبعض طرز الرمان في اليمن باستخدام تحاليل الـ RAPD

استخدمت تقانة الدنا المضخم عشوائياً (RAPD) لدراسة التنوع الوراثي لبعض طرز الرمان التـي بلغ عددها 11 طرازاً وراثياً جمعت من 3 مناطق رئيسية في شـرق الـيمن و وسـطه و شـماله (رداع، الحداء، صعدة) خلال العام 2004 م. تمت عمليه مكاثرة قطع الDNA و تضخيمها خلال التفاعل التسلسلي للبوليميراز (PCR) باسـتخدام 30 بادئة عشوائية أنتجت 1013 حزمة (شدفة) منها 118 أعطت تعددية شكلية 5.11 % و قد أوضحت النتائج أن الاختلاف الوراثي بين الطرز المستخدمة كان محدوداً حيث تراوحت درجه القرابة بينهـا مـن % 79 قدره بمتوسط % 96 -59 أظهر التحليل الإحصائي إمكانية تقسيم الطرز المدروسة إلى مجموعتين: الأولـى تضـم الطـرازين عرقبي و مليس في منطقه الحداء، أما المجموعة الثانية فتضم 9 طرز تنتمي إلى منـاطق صـعدة و رداع و الحداء. وجدت درجة عالية من القرابة الوراثية (90 – 96 %) بين طرز الرمـان خازمي، ليسي 1 ،ليسـي 2 ،طائفي، أحمر، بلدي في حين عدتْ بعض الطرز أصنافاً مستقلة نظراً لارتفاع درجه الاختلاف الوراثي بينها مثل طرازي الرمان عرقبي و مليس في منطقة الحداء بالإضافة إلى الطرز بحصم، صماطي، ليسـي 3 في منطقه صعدة.

الكشف عن الانعزال المنحرف في المجموعة النباتية أحادية الصيغة الصبغية المضاعفة من الشعير Hordeum vulgare L باستخدام المؤشرات الجزيئية الدناوية من التوابع البسيطة الترادفية

ُتعد هذه الدراسة سبقًا في تقيم الانحراف الماندلي الناتج عن مقارنة نباتات احادية الصيغة الصبغية المضاعفة والمنتجة بطريقة زراعة الأبواغ الذكرية الدقيقة مع أفراد الجيل الثاني F٢ للهجين نفسه WI٢٢٩١ تدمر من الشعير وذلك باستخدام المؤشرات الجزيئية من التوابع البسيطة الترادفية الدناوية (STMS).