ترغب بنشر مسار تعليمي؟ اضغط هنا

تقييم عدة طرائق لاستخلاص الDNA من نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروستات تابعة لجنس Begomovirus

Evaluating of several methods to DNA extract from pepper plants Capsicum annuum L to detect viruses belonging to the genus Begomovirus

1204   0   52   0 ( 0 )
 تاريخ النشر 2016
  مجال البحث وقاية نبات
والبحث باللغة العربية
 تمت اﻹضافة من قبل Shamra Editor




اسأل ChatGPT حول البحث

قيمت في هذه الدراسة عدة طرائق لاستخلاص الدنا من أوراق نباتات الفليفلة للكشف عن الفيروسات التابعة للجنس Begomovirusُ, و ذلك بالاعتماد على كمية و نوعية دنا المستخلص بقياس تركيزه و نسبة امتصاصه للضوء باستخدام المطياف الضوئي.


ملخص البحث
تهدف هذه الدراسة إلى تقييم كفاءة أربع طرائق لاستخلاص DNA من أوراق نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروسات الجنس Begomovirus باستخدام تقنية PCR. الطرائق المستخدمة هي CTAB، SDS، CTAB مع PVP، و Kcl/Na2SO3. تم قياس كمية ونوعية DNA المستخلص باستخدام المطياف الضوئي وتقييم نقاوته وسلامته. أظهرت النتائج تفوق طريقة SDS من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص، حيث بلغت نسبة 260/230 حوالي 0.623 ونسبة 280/260 حوالي 1.628. كذلك، أظهرت طريقة SDS سلامة الحزم بنسبة 70% في اختبار الرحلان الكهربائي، مما يجعلها الخيار الأمثل للكشف عن فيروسات Begomovirus في نبات الفليفلة.
قراءة نقدية
دراسة نقدية: على الرغم من أن الدراسة تقدم نتائج مهمة حول كفاءة طرق استخلاص DNA من نبات الفليفلة، إلا أن هناك بعض النقاط التي يمكن تحسينها. أولاً، كان من الأفضل تضمين مزيد من التفاصيل حول الظروف البيئية التي تم فيها جمع العينات، حيث يمكن أن تؤثر هذه الظروف على جودة DNA المستخلص. ثانياً، لم يتم مناقشة تأثير المواد الكيميائية المستخدمة في كل طريقة على البيئة أو صحة الباحثين. أخيراً، كان من الممكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل أنواع أخرى من النباتات للتحقق من عمومية النتائج.
أسئلة حول البحث
  1. ما هي الطرائق الأربع التي تم تقييمها لاستخلاص DNA في هذه الدراسة؟

    الطرائق الأربع هي CTAB، SDS، CTAB مع PVP، و Kcl/Na2SO3.

  2. ما هي الطريقة التي أظهرت أفضل نتائج من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص؟

    طريقة SDS أظهرت أفضل نتائج من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص.

  3. ما هي النسبة المثلى لنقاوة DNA المستخلص باستخدام طريقة SDS؟

    النسبة المثلى لنقاوة DNA المستخلص باستخدام طريقة SDS هي 1.628 لنسبة 280/260 و0.623 لنسبة 260/230.

  4. ما هي الفائدة العملية من استخدام طريقة SDS لاستخلاص DNA من نبات الفليفلة؟

    الفائدة العملية من استخدام طريقة SDS هي الحصول على DNA بنقاوة وتركيز عاليين، مما يسهل الكشف عن فيروسات Begomovirus باستخدام تقنية PCR.


المراجع المستخدمة
ANCHORDOQUY, T. MOLINA, M. 2007- Frontiers in clinical research. Cell Preserv. Technol. 5. 180-188
BARANWAL, V. MAJUMDER, S. AHLAWAT, Y. SINGH, R. 2003- Sodium sulphite yields improved DNA of higher stability for PCR detection of Citrus yellow mosaic virus from citrus leaves. J. Virol. Meth. 112. 153-156
BOSLAND,P.W. 1992- Chiles: adverse crop, Hort Technology. 2. 6-10
قيم البحث

اقرأ أيضاً

يعد جنس الـ Potyvirus من أهم الاجناس الفيروسية النباتية إذ يحتوي على حوالي 200 نوعاً فيروساً بعضها ذو أهمية كبيرة . بينت دراستنا الانتشار الواسع لفيروسات تابعة لهذا الجنس في مناطقة مختلفة من سورية وخلال مواسم متعاقبة وكانت نسبة الإصابة 54.25% على نب اتات العائلة القرعية وفي العينات التابعة للعائلة الباذنجانية 34.17% أما العائلة الصليبية كانت بنسبة 57.57% مما يدل على تواجد هذه الفيروسات وانتقالها من موسم لآخر.
هدف البحث الحالي إلى دراسة بعض المخصبات العضوية و الحيوية في الخصائص الإنباتية و نمو شتول الفليفلة. استخدم صنف الفليفلة "قرن الغزال" ، اختبر مركبان تجاريان عضوي (هيوبست Hubest ) و آخر حيوي (EM1). تضمنت الدراسة تجربتين ، الأولى بهدف دراسة أثر المخصبات في الخصائص الإنباتية لبذور الفليفلة ، زرعت البذور في أطباق بتري و في أحواض بلاستيكية مملوءة بالبيتموس. بينما هدفت التجربة الثانية إلى دراسة أثر المخصبات في نمو شتول الفليفلة . إذ جرى إعداد الشتول في صواني من الستريبور بأبعاد 5×5 سم مملوءة بالبيتموس داخل نفق بلاستيكي غير مدفأ. أظهرت النتائج أن نقع البذور في المخصبات ( العضوية و الحيوية) المستخدمة أدى إلى تنشيط الإنبات و زيادة قوة البذور، و كان هذا الدور أكثر وضوحاً عند النقع في محلول المركب الحيوي. إذ أظهرت البذور المعاملة بهذا المركب تفوقاً معنوياً في الصفات المدروسة . كما أظهرت الدراسة أن معاملة الشتول بالمخصبات أعطت زيادةً ملحوظة في معدل نمو الشتول ، تجلى في طول الشتلة ، و أعداد الأوراق ومساحة سطحها التمثيلي و كذلك في الوزن الرطب و الجاف للمجموع الخضري مع تفوق معنوي واضح للشتول المعاملة بالمركب الحيوي.
تم تنفيذ هذا البحث على محصول الفليفلة لدراسة تأثير الإجهاد المائي باستخدام ثلاث معاملات مائية: ري كامل ( 110 % من الاحتياج المائي ), و 75 % من الري الكامل, و 60 % من الري الكامل, و تم تصميم التجربة بطريقة القطاعات العشوائية الكاملة, استخدم الصنف البلدي لنبات الفليفلة, استخدمت طريقة الري بالتنقيط.
تم في هذه الدراسة استخلاص DNA من شرائح التجري المجهري عن الإصابة بداء الليشمانية. استخدمت ثلاث طرائق لاستخلاص DNA الأولى باستخدام محاليل ملحية جاهزة Promega Kit و الثانية تقليدية و الثالثة تعتمد استخدام أعمدة مزودة بأغشية من مادة سيليكاجيل طريقة Qia gen.
أظهرت دراسة جنس المنتعش Amaranthus L. في بعض المواقع في اللاذقية وجود 5 أنواع وهي: Amaranthus viridis L. , Amaranthus blitoides S. Wats., Amaranthus retroflexus L., Amaranthus palmeri S.Wats, Amaranthus sp. . النوع Amaranthus palmeri يُسجّل لأول مرة في سوريا، أما النوع Amaranthus viridis فقد كان مسجلاً في فلورا سوريا ولبنان كمرادف لنوع آخر هو Amaranthus lividus بينما سُجّلا في فلورات أخرى كنوعين منفصلين، والنوع Amaranthus sp. قد يرجع لهجين شكَّل نوعاً مستقلاً بالنظر إلى اختلافه كلياً عن الأنواع الأخرى المعروفة جيداً. . بينت دراسة حبات الطلع أنها من النمط الكروي عديد ثقوب الإنتاش Polypantoporate عند جميع الأنواع المدروسة، مع اختلاف بسيط بالأبعاد، واختلاف بعدد فتحات الإنتاش على الوجه المرئي للحبة حيث تراوح متوسط عدد الثقوب على الوجه الواحد بين 14 ثقباً عند Amaranthus retroflexus، و24 ثقباً عند Amaranthus palmeri. وقد بينت نتائج دراسة مسام الورقة وجود أربعة أنماط من المسام هي: Anisocytic, Anomocytic, Isotricytic, Tetracytic، حيث اشتركت الأنواع الخمسة بالنمط Anomocytic، ولوحظ وجود أكثر من نمط في الورقة الواحدة في كل الأنواع عدا النوع الجديد. وبينت الدراسة الإحصائية درجة القرابة بين الأنواع المدروسة، وأن النوع الجديد كان أقرب إلى النوع Amaranthus palmeri.
التعليقات
جاري جلب التعليقات جاري جلب التعليقات
سجل دخول لتتمكن من متابعة معايير البحث التي قمت باختيارها
mircosoft-partner

هل ترغب بارسال اشعارات عن اخر التحديثات في شمرا-اكاديميا