تشخيص وكشف فيروس التهاب القصبات المعدي باستخدام تقنية RT-PCR في مزارع دجاج اللحم في سورية

استُخدمت تقانة تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي (reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR للكشف عن فيروس التهاب القصبات المعدي IBV) infectious bronchitis virus) في قطعان الفروج التجارية في سورية، حيث جمعت 50 عينة مرضية مشتبهة من أنسجة الرغامى في القصبة الهوائية، والكلى، من 50 قطيع من دجاج اللحم (الفروج) المشتبه بإصابتها بمرض التهاب القصبات المعدي infectious bronchitis (IB)، والموزّعة في مناطق مختلفة من سورية (اللاذقية، وطرطوس، وحماه، وريف دمشق). حيث تم استخلاص الحمض النووي الفيروسي RNA من أنسجة العينات المرضية مباشرة، ومن ثم تحويل RNA إلى cDNA بتقنية النسخ العكسي RT-PCR، واخضاعها لاختبار تفاعل PCR، وتفاعل Nested PCR. اختيرت البادئات المستخدمة في تفاعل RT-PCR من تحت وحدة S1 للمورثة S) spike) التي تتركز فيها الطفرات التي تصيب مورثة الفيروس في هذه المنطقة (منطقة شديدة التباين)، كما تم تمرير 10 من العينات الإيجابية المحتوية على الفيروس بأجنة الدجاج النامية الخالية من العوامل الممرضة، Specific pathogen free embryonated egg ((SPF بعمر 9-11 يوم تحضين وحسب الطرق المعتمدة في علم الفيروسات. نُفذ البحث في مخابر الهيئة العامة للبحوث العلمية الزراعية (مركز بحوث اللاذقية) بالتعاون مع مخبر PCR في كلية الطب البيطري بحماه. بيّنت نتائج اختبار RT-PCR، وجود 37 حالة إيجابية للاختبار وبنسبة 74% من عينات المزارع المختبرة، وأظهرت نتائج الحقن في أجنة الدجاج النامية آفات تشريحية واضحة ومميزة لفيروس التهاب القصبات المعدي بعد 5- 6 أيام من الحقن، وتأخر وعدم تطور ونمو الجنين (تقزم)، وتشابك أصابع ونزف دموي، بالمقارنة مع الشاهد السلبي، وأظهرت النتائج أيضاً حساسية تقنية RT-PCR للكشف عن فيروس IBV.

تأثير العمر، الجنس و بعض العوامل الجينيّة على شدة التهاب النسج حول السنيّة المزمن عند مرضى سوريين

إنّ التهاب النسج حول السنيّة المزمن مرضٌ إنتانيّ، يتّصف بالتهابٍ لثويّ يمتدّ إلى النسج حول السنيّة المجاورة، مؤدياً لتشكل جيوب حول سنيّة، و خسارة في الارتباط السريري، و العظم السّنخيّ المجاور، يحدث غالباً عند البالغين، و لكن يمكن مشاهدته في أيّ عمر، و يتأثّر معدّل تطوّر المرض بالعوامل الموضعية و/أو الجهازية، و البيئيّة، التي تعدّل استجابة الثوي المناعيّة تجاه اللويحة البكتيريّة، مايزيد الحساسيّة تجاه المرض، و يُعتقد أن الاستعداد للمرض حول السني يرتبط جزئياً بالاستعداد الجيني، و قد تمّ تحديد العديد من الجينات التي تعتبر مواضع كامنة للاستعداد للالتهاب، و أحد أهمها مستقبل الفيتامين د VDR الذي يتواسط فعالية الفيتامين د الحيوية في استقلاب العظم، و تعديل الاستجابة المناعيّة. هدفت دراستنا للتحرّي عن علاقة العمر، الجنس، و التعدّد الشكلي FokI في جين مستقبل الفيتامين د بالحالة السريريّة لمرضى سوريين بالتهاب النسج حول السنيّة المزمن، حيث شملت العيّنة على 50 مريضاً بمتوسط عمر (0.722±64)عاماَ، و30 حالة شاهدة (0.63±50) عاماَ، و تمّ عزل الدنا DNA من الدم المحيطي، و إجراء تفاعل البوليميراز التسلسلي PCR، و هضم شدف الدنا المضخّمة بأنزيم قطع FokI. أظهرت دراستنا بتطبيق اختبار كاي مربع Chi-square عدم وجود فروقٍ يعتدّ بها إحصائياً بين مجموعتيّ الدراسة من حيث العمر، الجنس، و توزع الأنماط الجينيّة و الأليلات في الموقع FokI من جينVDR، و ضمن حدود هذا البحث بمكن القول أنّ هذه العوامل لا تؤهّب لحدوث المرض، أو تؤثّر على درجة تطوّره.

تحديد مسبب مرض إلتهاب الجلد الأحمر Erythrodermatitis عند الكارب العادي باستخدام العزل الجرثومي و تقنية تفاعل البوليميز المتسلسل PCR

أجريت هذه الدراسة لتحديد المسبب لإلتهاب الجلد الأحمر عند أسماك الكارب في محافظة حماة سورية باستخدام العزل الجرثومي و تم تحديد الأنواع المعزولة باستخدام اختبارات الكيمياحيوية و تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل.

مقارنة بين الطرائق التقليدية و الحديثة في تشخيص خميرة الخبز المعزولة من مركزات عصير التفاح

نفذ هذا البحث في مخابر قسم علوم الأغذية بكلية الزراعة بجامعة دمشق، و بمخبر الميكروبيولوجيا و المناعيات في هيئة الطاقة الذرية، حيث أخذ 20 كغ من مركز عصير التفاح بتركيز 70 % من معمل عصير الجبل الطبيعي في محافظة السويداء و منه حضر كل من التركيزيين 35%-15% بإضافة الماء المقطر و المعقم حسب طريقة بيرسون.

دراسة تواجد جين P27 في الليشمانية المدارية L.tropica و دراسة تعبيرها الجيني في مشيقات Promastigote الليشمانية المدارية

في هذه الدراسة قمنا بدراسة التعبير الجيني عن P27 في الشكل المشيقي لليشمانية المدارية بواسطة تقانة Reverse Transcriptase Polymerase Chain RT-PCR) Reaction) مستخدمين زوجاً من المشارع النوعية التي تم تصميمها يدوياً بالاعتماد على تسلسل هذه الجين في الأنواع الأخرى من الليشمانية بعد تحديد و معرفة المناطق المصانة من التسلسل، و أظهرت النتائج إثبات تواجد جين P27 في جينوم الليشمانية المدارية إلى جانب وجود تعبير جيني لها في الشكل المشيقي.

الكشف عن جراثيم الليسترية في اللحوم الحمراء

هدفت الدراسة للكشف عن وجود جراثيم Listeria في لحوم البقر المفرومة و المعدة للاستهلاك، حيث تم جمع عينات اللحوم من محافظة دمشق و ريفها و القنيطرة و السويداء، في الفترة بين شباط 2015 و شباط 2016 .

تقييم عدة طرائق لاستخلاص الDNA من نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروستات تابعة لجنس Begomovirus

قيمت في هذه الدراسة عدة طرائق لاستخلاص الدنا من أوراق نباتات الفليفلة للكشف عن الفيروسات التابعة للجنس Begomovirusُ, و ذلك بالاعتماد على كمية و نوعية دنا المستخلص بقياس تركيزه و نسبة امتصاصه للضوء باستخدام المطياف الضوئي.

تقييم طريقة Multiplex PCR لكشف نسخ الرنا المرسال للجين المندمج BCR-AbL لدى مرضى الابيضاض النقوي المزمن

تقييم طريقة Multiplex PCR لكشف نسخ الرنا المرسال للجين المندمج BCR-AbL لدى مرضى الابيضاض النقوي المزمن

الكشف عن الذيفانات المعوية في العنقوديات الذهبية

أجري البحث على 450 عينة ( 150 عينة لحم صدر – 150 عينة لحم فخد – 150 عينة لحم جناح ) ، جمعت من محلات بيع لحم الدجاج المنتشرة في مدينة حماة للكشف عن تلوثها بالعنقوديات، حيث أظهرت نتائج العزل الجرثومي و الاختبارات الكيمياحيوية وجود 407 عينة إيجابية للعنقوديات منها 73 عزلة ( 16.2 % ) من العنقوديات الذهبية و 334 عزلة ( 83.8 % ) من العنقوديات سالبة المخثراز. كما أظهرت نتائج اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد Multiplex PCR على 73 عزلة من العنقوديات الذهبية، وجود 37 ( 50.7% ) عزلة تحتوي على الأقل على مورث واحد مرمز للذيفانات المعوية, و ان المورث sea هو الأكثر مصادفة.

تحديد هوية بكتيريا Lactococcus Lactis في جبن الغنم السوري باستخدام تقنيتي الـ FTIR و PCR

أجريت الدراسة في مخابر كلية الزراعة قسم علوم الاغذية ومخابر الميكروبيولوجيا والمناعيات بقسم البيولوجيا الجزيئية والتقانة الحيوية بهيئة الطاقة الذرية.