Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new userPhylogenetic relationships among Triticum L. and Aegilops L. species based on the internal transcribed spacer sequences of nrDNA (ITS)
العلاقات التطورية بين أنواع من Aegilops L. و Triticum L.باستخدام internal transcribed spacer sequences(ITS) nrDNA
1201
0 118
0
(
0
)
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
يهدف هذا البحث الى دراسة علاقات القرابة الوراثية بين أنواع من Aegilops L. و Triticum L. باستخدام internal transcribed spacer (ITS) و قد استخدم في هذه الدراسة 8 أنواع من Aegilops L. و 7 أنواع من Triticum L. تم تحليل التسلسل لمنطقة ((ITS باستخدام برنامج (CLUSTAL W 2.1 multiple sequence aligment program) و درست علاقات القرابة الوراثية بين الأنواع باستخدام المتوسط الحسابي للمجموعات الزوجية غير المزانة Unweighted Pair Group Mean Arithmetic Average (UPGMA) و. (NJ)and neighbor-joining.
The research Studies genetic relationships among Triticum L. and Aegilops L. species by direct sequencing of PCR-amplified internal transcribed spacer (ITS) of nuclear ribosomal DNA to investigate the polymorphism in nucleotide sequences among 8 Aegilops L. and 7 Triticum L. species. ITS sequences were aligned with CLUSTAL W 2.1 multiple sequence aligment program. The phylogenetic relationships among species were reconstructed using Unweighted Pair Group Mean Arithmetic Average (UPGMA) and neighbor-joining (NJ) methods.
Artificial intelligence review:
Research summary
تتناول هذه الدراسة العلاقات التطورية بين أنواع من جنس Triticum L. و Aegilops L. باستخدام تسلسل المنطقة الفاصلة الداخلية (ITS) من الحمض النووي الريبوزي النووي (nrDNA). تم تحليل تسلسل ITS باستخدام برنامج CLUSTAL W 2.1 وتم إعادة بناء العلاقات التطورية باستخدام طريقتي UPGMA و NJ. أظهرت النتائج أن طول منطقة ITS يتراوح بين 600-602 قاعدة نيتروجينية، مع تباين في محتوى G + C بين الأنواع المختلفة. كما تم تحديد 54 موقعًا متغيرًا في منطقة ITS، وكانت الأنواع T. dicoccon و T. durum أكثر تباينًا من الأنواع الأخرى. أظهرت شجرة القرابة الوراثية وجود ثلاث مجموعات رئيسية، حيث كان النوع T. urartu منفصلًا عن T. monococcum، وأظهرت النتائج تشابهًا وراثيًا بين T. dicoccoides و T. monococcum نتيجة لحدث تهجين حديث. توصلت الدراسة إلى أن منطقة ITS يمكن أن تكون أداة فعالة في تحديد العلاقات التطورية بين الأنواع القريبة في Triticeae وأنواع نباتية أخرى.
Critical review
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة مهمة في مجال البيولوجيا الجزيئية وعلم الوراثة النباتية، حيث تقدم معلومات قيمة حول العلاقات التطورية بين أنواع من جنس Triticum و Aegilops. ومع ذلك، يمكن أن تكون هناك بعض النقاط التي تحتاج إلى مزيد من التوضيح أو التحسين. على سبيل المثال، كان من الممكن تقديم تحليل أعمق للتباين الجيني بين الأنواع المختلفة وتأثير ذلك على التهجين والتطور. كما أن الدراسة اعتمدت بشكل كبير على تحليل ITS فقط، وكان من الممكن تعزيز النتائج باستخدام مؤشرات جزيئية أخرى لدعم الاستنتاجات. بالإضافة إلى ذلك، يمكن أن تكون هناك حاجة إلى دراسة تأثير العوامل البيئية على التباين الجيني والعلاقات التطورية بين الأنواع المدروسة.
Questions related to the research
-
ما هي الأداة المستخدمة لتحليل تسلسل ITS في الدراسة؟
تم استخدام برنامج CLUSTAL W 2.1 لتحليل تسلسل ITS.
-
كم كان طول منطقة ITS في الأنواع المدروسة؟
تراوح طول منطقة ITS بين 600-602 قاعدة نيتروجينية.
-
ما هي الأنواع التي أظهرت أكبر تباين في منطقة ITS؟
الأنواع T. dicoccon و T. durum أظهرت أكبر تباين في منطقة ITS.
-
كم عدد المواقع المتغيرة التي تم تحديدها في منطقة ITS؟
تم تحديد 54 موقعًا متغيرًا في منطقة ITS.
References used
AL-AHMAR, E., HAIDER, N., AZZAM. H. 2010. Genetic Relationships among Aegilops L. Species Using DNA Molecular Markers. General Commission for Scientific Agricultural Research, Gene Bank Division, Faculty of Agriculture, Damascus University. Syria
BADAEVA, E., FRIEBE, B., GILL. B. 1996. Genome differentiation in Aegilops. Physical mapping of 5S and 18S–26S ribosomal RNA gene families in diploid species. Genome 39:1150–1158
F., CAMPELL, C. S., DONOGHUE, M. J., 1995. The ITS region of nuclear ribosomal DNA: a valuable source of evidence on angiosperm phylogeny. Ann. Mol. Bot. Gard.,82, 247–277
rate research
Read More
This research was conducted at the farm of Abu-Jarash, Faculty of
Agriculture, Damascus University. The aim of this research was to
evaluate the performance and productivity of 9 bread wheat (T.
.aestivum )and 3 durum wheat T. durum.
The experiment was laid out in a Random Complete Block design
(RCPD) with three replication.
Five species of the genus Poa L. from (Poaceae) were collected and studied in
Lattakia, they are : P. annua ، P.infirma ، P. pratensis ، P. bulbosa ،P. nemoralis.
This study put data base of the morphological features which included : habit, leaves
,
ligule, the structure of the inflorescence , spikelet, floret, micro-morphological
characteristics which contained the epidermal structure of abaxial leaf surface, and the
difference between costal and inter-costal zones of the 5 species, studying of pollen grain
clarified the similarity in shape but there was a simple difference in measurements . Then ,
data from micro and macro morphological study were used to made a Dendrogram by
using Statistica . The dendrogram showed the linkage of two annual species P. annua ،
P.infirma in a cluster , every one of three another species had his specific cluster , P.
nemoralis was closer to the annual species .
This research was conducted to determine the most responsive phenological
stage for supplementary irrigation of the durum wheat in a primary stationary
region.
It consisted of six different water treatments in addition to control (non
irrigated)
:
1-From planting to seedling emergence; 2-From planting to tillering; 3-From
planting to booting; 4-From planting to flowering; 5-From planting to the end of
the milk stage; 6–Sowing irrigation and irrigation according to necessity
throughout the milk stage.
The study has been repeated in four blocks for three seasons from 2002 to
2005. The results of the first two seasons showed that the:
The treatment from planting to booting, was canceled because of the rain and
soil dampness during this growth period. A significant increase in production,
water use efficiency, and one 1000 kernel weight, of both 5th and 6th treatments was
noticed in comparison with other treatments and the control. Results of the three
seasons were varied due to the environmental variation in temperature and amount
of rainfall.
This research was conducted at Tal Shnan village, located at the eastern of Homs
city, Syria during 2012/ 2013 growing season, using hard local wheat cultivar,
Sham 5, to study the effect of seed rates (120, 150, 180, 210 kg/ha), spray with
differ
ent parts of sorghum water extracts using different, and weeding on wheat
yield and weeds accompany with the crop.
This study indicated the presence of different shapes and sizes of grains starch in
Milky liquid (latex) for 10 speciec of genus euphorbia these:
, E.geniculata , E.pilulifera , E. serpens, E.prostrata , E. thamnoides
E. paralias , E. terracina, E
. aleppica , E. peplus, , E. helioscopia
which varied between: (Rod) ,(Spindle), (Slightly osteoid), (Osteoid), (Dumb-blle),
(Ostcoid branched), intermediate forms with indentation and accessories , pollen grains
werw: spherical, or oval-shaped 3-colporate, It is of the Euphorbia hirta- type , and
Ornamentation Tectum coarsely reticulate in (E.geniculata) only, and fine reticulate in the
others species , and size of a Pollen grains differed between species .The largest size
found in E. geniculata (P= 46.21mμ , E = 44.68 mμ)For spherical shape and (P =42.56 =
m μ, E =37.54 mμ )For elongated shape.The smallest size found in E.pilulifera (P=16mμ ,
E 15.62 =mμ)For spherical shape and (P = 17.68 m μ, E13 .12 =mμ ) For elongated
shape.
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
