Subscribe to the gold package and get unlimited access to Shamra Academy
Register a new userEvaluating of several methods to DNA extract from pepper plants Capsicum annuum L to detect viruses belonging to the genus Begomovirus
تقييم عدة طرائق لاستخلاص الDNA من نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروستات تابعة لجنس Begomovirus
1210
0 52
0
(
0
)
Added by
Aِl-Baath University ورقة بحثية
Publication date
2016
fields
Plant Protecion
and research's language is
العربية
Created by
Shamra Editor
Ask ChatGPT about the research
قيمت في هذه الدراسة عدة طرائق لاستخلاص الدنا من أوراق نباتات الفليفلة للكشف عن الفيروسات التابعة للجنس Begomovirusُ, و ذلك بالاعتماد على كمية و نوعية دنا المستخلص بقياس تركيزه و نسبة امتصاصه للضوء باستخدام المطياف الضوئي.
Several protocols for DNA extraction from leaves of pepper Capsicum annuum L. were evaluated to detect Begomoviruses. The extraction methods comparison were based on DNA quantity and quality. The DNA concentration absorbance for the evaluation of DNA concentration and contamination were measured using spectrophotometer.
Artificial intelligence review:
Research summary
تهدف هذه الدراسة إلى تقييم كفاءة أربع طرائق لاستخلاص DNA من أوراق نبات الفليفلة Capsicum annuum L للكشف عن فيروسات الجنس Begomovirus باستخدام تقنية PCR. الطرائق المستخدمة هي CTAB، SDS، CTAB مع PVP، و Kcl/Na2SO3. تم قياس كمية ونوعية DNA المستخلص باستخدام المطياف الضوئي وتقييم نقاوته وسلامته. أظهرت النتائج تفوق طريقة SDS من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص، حيث بلغت نسبة 260/230 حوالي 0.623 ونسبة 280/260 حوالي 1.628. كذلك، أظهرت طريقة SDS سلامة الحزم بنسبة 70% في اختبار الرحلان الكهربائي، مما يجعلها الخيار الأمثل للكشف عن فيروسات Begomovirus في نبات الفليفلة.
Critical review
دراسة نقدية: على الرغم من أن الدراسة تقدم نتائج مهمة حول كفاءة طرق استخلاص DNA من نبات الفليفلة، إلا أن هناك بعض النقاط التي يمكن تحسينها. أولاً، كان من الأفضل تضمين مزيد من التفاصيل حول الظروف البيئية التي تم فيها جمع العينات، حيث يمكن أن تؤثر هذه الظروف على جودة DNA المستخلص. ثانياً، لم يتم مناقشة تأثير المواد الكيميائية المستخدمة في كل طريقة على البيئة أو صحة الباحثين. أخيراً، كان من الممكن توسيع نطاق الدراسة لتشمل أنواع أخرى من النباتات للتحقق من عمومية النتائج.
Questions related to the research
-
ما هي الطرائق الأربع التي تم تقييمها لاستخلاص DNA في هذه الدراسة؟
الطرائق الأربع هي CTAB، SDS، CTAB مع PVP، و Kcl/Na2SO3.
-
ما هي الطريقة التي أظهرت أفضل نتائج من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص؟
طريقة SDS أظهرت أفضل نتائج من حيث تركيز ونقاوة DNA المستخلص.
-
ما هي النسبة المثلى لنقاوة DNA المستخلص باستخدام طريقة SDS؟
النسبة المثلى لنقاوة DNA المستخلص باستخدام طريقة SDS هي 1.628 لنسبة 280/260 و0.623 لنسبة 260/230.
-
ما هي الفائدة العملية من استخدام طريقة SDS لاستخلاص DNA من نبات الفليفلة؟
الفائدة العملية من استخدام طريقة SDS هي الحصول على DNA بنقاوة وتركيز عاليين، مما يسهل الكشف عن فيروسات Begomovirus باستخدام تقنية PCR.
References used
ANCHORDOQUY, T. MOLINA, M. 2007- Frontiers in clinical research. Cell Preserv. Technol. 5. 180-188
BARANWAL, V. MAJUMDER, S. AHLAWAT, Y. SINGH, R. 2003- Sodium sulphite yields improved DNA of higher stability for PCR detection of Citrus yellow mosaic virus from citrus leaves. J. Virol. Meth. 112. 153-156
BOSLAND,P.W. 1992- Chiles: adverse crop, Hort Technology. 2. 6-10
rate research
Read More
The genus Potyvirus is one of the most important plant viral genera, as it contains about 200 virus species, some of which are of great importance. Our study showed the wide spread of viruses belonging to this genus in different regions of Syria and
during successive seasons, and the infection rate was 54.25% on the plants of the cucurbit family, and in the samples of the Solanaceae family 34.17%, while the cruciferous family was at a rate of 57.57%, which indicates the presence of these viruses and their transmission from one season to another.
The aim of this study was to test the effeciency of some organic and bio fertilizers in
improving the seeds germination and transplants growth of pepper Capsicum annum L.
local variaty" Qorn Algazal":by using two commercial compounds; organic (Hube
st) and
one bio (EMI) fertilizers. Two experiments were used; the aim of the first was to study the
effect of these fertilizers on germination of seeds in Petri dishes and plastic peatmoss peds.
Whereas the aim of the second experiment was to evaluate the effect of the fertilizers on
the pepper transplants growth that prepared in the 5 * 5 Striopor peatmoss plates placed in
un warmed plastic tunnel.
The results showed that the soaking of pepper seeds in the tested fertilizers, provoked
and the germination increased the seeds, vigor, with a significant performance of the bio
fertilizer.
The results also showed that the treated transplants with the tested fertilizers gave an
increase of the transplants growth ratio (the height, leaves number and foliar surface area,
the dry and wet weight) with a significance superiority of the bio fertilizer.
This research on pepper crop conducted to impact water stress using
three transactions water are: full irrigation (100% from water
requirement), 0.75% of full irrigation, and 60% of full irrigation,
has been designed experiment in a way random sectors full, use a
variety of municipal plant peppers, and used drip irrigation method.
DNA was extraction from scanning microscopic slides to
identification leishmaniases. Three methods used to DNA
extraction, first one using ready extraction solvent (Promega kit),
second depended on phenol-chloroform-iso propanol , whereas third
one depended on columns with silica gel membranes (Qia gen kit).
The results showed that (Promega kit) method didn’t gave high
concentration of DNA. (Qia gen kit) method was the best for DNA
concentration and purity
أظهرت دراسة جنس المنتعش Amaranthus L. في بعض المواقع في اللاذقية وجود 5 أنواع وهي: Amaranthus viridis L. , Amaranthus blitoides S. Wats., Amaranthus retroflexus L., Amaranthus palmeri S.Wats, Amaranthus sp. .
النوع Amaranthus palmeri يُسجّل لأول مرة في سوريا، أما النوع Amaranthus viridis فقد كان مسجلاً في فلورا سوريا ولبنان كمرادف لنوع آخر هو Amaranthus lividus بينما سُجّلا في فلورات أخرى كنوعين منفصلين، والنوع Amaranthus sp. قد يرجع لهجين شكَّل نوعاً مستقلاً بالنظر إلى اختلافه كلياً عن الأنواع الأخرى المعروفة جيداً. . بينت دراسة حبات الطلع أنها من النمط الكروي عديد ثقوب الإنتاش Polypantoporate عند جميع الأنواع المدروسة، مع اختلاف بسيط بالأبعاد، واختلاف بعدد فتحات الإنتاش على الوجه المرئي للحبة حيث تراوح متوسط عدد الثقوب على الوجه الواحد بين 14 ثقباً عند Amaranthus retroflexus، و24 ثقباً عند Amaranthus palmeri. وقد بينت نتائج دراسة مسام الورقة وجود أربعة أنماط من المسام هي: Anisocytic, Anomocytic, Isotricytic, Tetracytic، حيث اشتركت الأنواع الخمسة بالنمط Anomocytic، ولوحظ وجود أكثر من نمط في الورقة الواحدة في كل الأنواع عدا النوع الجديد. وبينت الدراسة الإحصائية درجة القرابة بين الأنواع المدروسة، وأن النوع الجديد كان أقرب إلى النوع Amaranthus palmeri.
Log in to be able to interact and post comments
comments
Fetching comments
Sign in to be able to follow your search criteria
