ترغب بنشر مسار تعليمي؟ اضغط هنا

دراسة حساسية تقانة PCR Nested في كشف الرشاشية الدخناء في عينات قشع مخموجة تجريبي

Testing the sensitivity of Nested PCR method to detect Aspergillus fumigates in experimentally infected Sputum samples

1210   0   10   0 ( 0 )
 تاريخ النشر 2012
  مجال البحث الصيدلة
والبحث باللغة العربية
 تمت اﻹضافة من قبل Shamra Editor




اسأل ChatGPT حول البحث

تحتل الإصابات الفطرية المسببة بأنواع فطر الرشاشية Aspergillus عمومـاً، المرتبـة الثانيـة عالمياً بين الإصابات الفطرية الغازيـة، و بـشكل خـاص، تعـد الرشاشـية الـدخناء Aspergillus fumigatus المسبب الرئيسي لداء الرشاشيات الغازي (IA (Aspergillosis Invasive . و على الرغم من أن هذا الداء نادراً ما يصيب الأفراد سليمي المناعة، إلا أنه يؤدي إلى الوفاة لـدى الأشخاص المضعفين مناعياً، لذلك فمن الضروري تشخيصه بشكلٍ مبكر، لمعالجتـه بـشكلٍ نـاجع. إن الأدوات التشخيصية التقليدية المتبعة حالياً للكشف عن الإصابات هي الاستنبات على وسط سـابورو، إذ تتصف هذه الطريقة بأنها ذات حساسية منخفضة و موثوقية ضعيفة. و قد سمح لنا انتشار تقانة التفاعل السلـسلي للبـوليميراز PCR-Nested كتقانـة جزيئيـة ذات حساسية عالية، بإجراء دراسة مقارنة بين حساسية كلتا الطريقتين التقليدية المتبعة و PCR-Nested، 6 و أظهرت نتائج الدراسة على عينات قشع مخموجة تجريبياً بتراكيز مختلفـة راوحـت بـين 10 -10 بوغة/مل، حساسية تقانة PCR-Nested و نوعيتها في الكشف عن أدنى التراكيز، مقارنـة بطريقـة التشخيص التقليدية المتمثلة بالاستنبات الفطري على وسط سابورو التي كانت سلبية للتراكيز جميعها.


ملخص البحث
تتناول الدراسة حساسية تقانة Nested PCR في كشف فطر الرشاشية الدخناء في عينات القشع المخموجة تجريبياً. تعتبر الإصابات الفطرية المسببة بفطر الرشاشية من الإصابات الخطيرة التي تؤدي إلى الوفاة لدى الأشخاص المضعفين مناعياً. تعتمد الطرق التقليدية للكشف عن هذه الإصابات على الاستنبات الفطري على وسط سابورو، والتي تتميز بحساسية منخفضة وموثوقية ضعيفة. في هذه الدراسة، تم مقارنة حساسية تقانة Nested PCR مع الطريقة التقليدية للكشف عن فطر الرشاشية الدخناء. أظهرت النتائج أن تقانة Nested PCR تتميز بحساسية ونوعية عالية في الكشف عن الفطر حتى في التراكيز المنخفضة، بينما كانت نتائج الاستنبات الفطري سلبية لجميع التراكيز المستخدمة. تم الحصول على عينات القشع من شخص سليم، وتم تخميجها بتراكيز مختلفة من أبواغ الفطر. تم استنبات العينات على وسط سابورو كلورامفينيكول، واستخلص DNA الجينومي الفطري من العينات وأجريت عليها تقانة Nested PCR. أظهرت النتائج أن تقانة Nested PCR قادرة على الكشف عن الفطر في جميع التراكيز المستخدمة، مما يبرز فعاليتها العالية مقارنة بالطريقة التقليدية.
قراءة نقدية
دراسة نقدية: تعتبر هذه الدراسة خطوة مهمة نحو تحسين طرق التشخيص للإصابات الفطرية الغازية، وخاصة داء الرشاشيات. ومع ذلك، يمكن توجيه بعض النقد البناء للدراسة. أولاً، كان من الممكن توسيع حجم العينة لتشمل مزيداً من العينات من مرضى حقيقيين بدلاً من العينات المخموجة تجريبياً، مما يعزز من موثوقية النتائج وتطبيقها في الواقع العملي. ثانياً، لم تتناول الدراسة بشكل كافٍ العوامل المحتملة التي قد تؤثر على حساسية تقانة Nested PCR، مثل وجود ملوثات أو تداخلات من مكونات أخرى في العينات. أخيراً، كان من الممكن مقارنة تقانة Nested PCR مع تقانات جزيئية أخرى مثل Real-Time PCR لتقديم صورة أشمل عن أفضل الطرق المتاحة للكشف عن فطر الرشاشية الدخناء.
أسئلة حول البحث
  1. ما هي الفطريات التي تسبب داء الرشاشيات الغازي؟

    الفطريات التي تسبب داء الرشاشيات الغازي هي أنواع فطر الرشاشية، وخاصة الرشاشية الدخناء (Aspergillus fumigatus).

  2. ما هي الطريقة التقليدية المستخدمة للكشف عن فطر الرشاشية الدخناء؟

    الطريقة التقليدية المستخدمة للكشف عن فطر الرشاشية الدخناء هي الاستنبات الفطري على وسط سابورو كلورامفينيكول.

  3. ما هي مزايا تقانة Nested PCR مقارنة بالطريقة التقليدية؟

    تتميز تقانة Nested PCR بحساسية ونوعية عالية في الكشف عن فطر الرشاشية الدخناء حتى في التراكيز المنخفضة، مقارنة بالطريقة التقليدية التي تتميز بحساسية منخفضة وموثوقية ضعيفة.

  4. ما هي العوامل التي قد تؤثر على حساسية تقانة Nested PCR؟

    العوامل التي قد تؤثر على حساسية تقانة Nested PCR تشمل وجود ملوثات أو تداخلات من مكونات أخرى في العينات، وكذلك جودة ونقاء DNA المستخلص.


المراجع المستخدمة
Araujo R. & Rodrigues A. G. (2004). Variability Of Germinative Potential among Pathogenic Species of Aspergillus. J. Clin Microbiol 42, 4335-4337
Bansod S., Gupta I. & Rai M. (2008). Specific detection of Aspergillus fumigatus in sputum sample of pulmonary tuberculosis patients by twostep PCR. African Journal of Biotechnology 7, 16-21
Bodey G., Bueltmann B. & Duguid W., et al.. (1992). Fungal infections in cancer patients: an international autopsy survey. Eur. J. Clin Microbiol Infect Dis 11, 99-109
قيم البحث

اقرأ أيضاً

ُنفذ البحث في الموسم 2011-2012 في مخابر قسم التقانات الحيوية التابع للهيئة العامة للبحـوث العلمية الزراعية بهدف الكشف عن وجود بيوض Giardia على 120 عينة شملت 40 عينة ميـاه ري و 80 عينة خضار جمعت عشوائياً من عشر مناطق زراعية مختلفة ضمن محافظة ريف دمش ق باستخدام تقانة الـPCR .بينت نتائج الدراسة بعـد فـصل نـواتج تفاعـل PCR أن النـسبة المئويـة للتلـوث بـِ Giardia كانت %8.25 ، موزعةً على %5.37 في عينات مياه الري و %20 في عينات الخـضار. تَبين وجود بيوض النوع lamblia. G في 15 عينة من أصل المجموع الكلي للعينـات توزعـت علـى 7 عينات مياه ري و 8 عينات خضار. أعطت منطقة مسرابا أعلى نسبة تلـوث %6.41 بالنـسبة إلـى الجنس Giardia و %25 بالنسبة إلى النوع lamblia. G و دون فرق معنوي مع منطقة الكفرين التـي أظهرت أقـل نـسبة تلـوث (33.8%) بالنـسبة لِــ Giardia ،G و خلوهـا مـن بيـوض النـوع lamblia. G .أكدت هذه الدراسة أهمية تطبيق طرائق البيولوجيا الجزيئية في الكشف عن وجـود هـذا الطفيلي على الخضار و المياه المروية بها، و قد أظهرت أزواج المرئسات المستخدمة نوعيـة و حـساسية عاليتين في الكشف عن الجنس Giardia و تمييز النوع الممرض للإنسان lamblia. G.
ينتشر داء الليشمانيا في ثمانٍ و ثمانين دولة من دول العالم و منها الجمهوريـة العربيـة الـسورية، و يسبب هذا الداء طفيلي وحيد خلية من أنواع جنس الليشمانيا، و ينتمي لهذا الجنس نحو اثنين و عشرين نوعاً ممرضاً للإنسان. يعرف للداء ثلاثة أشكال سريرية هي الدا ء الجلدي و الداء الجلدي المخاطي و الداء الحشوي. و قد طُورت مجموعة من طرائق التشخيص و تحديد نوع الطفيلي بهدف إعطاء العلاج المناسب، يتضمن التحليل الايزوانزيمي و الطرائق المصلية المناعية و تقانات تهجين DNA و لعل من أهم الطرائـق الجزيئية المعتمدة حالياً في تشخيص هذا الداء و معرفة نوع الطفيلي المسبب و أدقها هي تقنيـة التفاعـل السلسلي للبوليميراز PCR التي تعتمد إما على DNA الجينومي أو DNA الكينيتوبلاستي. قمنا في هذا العمل باستفراد نمطي DNA في خطوة واحدة من عزلات مأخوذة من أفراد مـصابين بـداء الليـشمانيا الجلدية و مستنبتة في المختبر. و اِستُخدم DNA الكينيتوبلاستي لتحديد نوع الطفيلـي باسـتخدام تقنيـة PCR؛ و ذلك بوجود مرئسات نوعية تضخم شدفاً ذات أطوال مختلفة مميزة لنوع الطفيلي. و قد حدد فـي هذه الدراسة نوع الطفيلي المسبب لداء الليشمانيا الجلدية عند هـؤلاء المـصابين، و تبـين أن العـزلات المدروسة جميعها هي من نوع الليشمانيا المدارية tropica. L.
مشاركات المستخدم التي تعتمد سممتها المتصورة على سياق المحادثة نادرة في مجموعات بيانات الكشف عن السمية الحالية.وبالتالي، فإن كاشفات السمية المدربين على مجموعات البيانات الحالية ستتجاهل السياق أيضا، مما يجعل اكتشاف سمية حساسة للسياق أكثر صعوبة بكثير عن د حدوث ذلك.قمنا بناؤنا وتحرير علني مجموعة بيانات من مشاركات 10K مع نوعين من تسميات سمية لكل مشاركة، تم الحصول عليها من المعلقين الذين اعتبروا (ط) كل من المنصب الحالي والآخر سياق، أو (II) فقط الوظيفة الحالية فقط.نقدم مهمة جديدة، وتقدير حساسية السياق، الذي يهدف إلى تحديد المشاركات التي تتغير سميةها المتصورة إذا تم النظر في السياق (المنشور السابق) أيضا.باستخدام DataSet الجديد، نظهر أن الأنظمة يمكن تطويرها لهذه المهمة.يمكن استخدام هذه الأنظمة لتعزيز مجموعات بيانات الكشف عن السمية مع المزيد من المشاركات التي تعتمد على السياق أو أن توحي عندما ينبغي للمشرفين النظر في الوظائف الأصلية، والتي قد لا تكون ضرورية دائما وقد تقدم تكاليف إضافية.
هدف هذا البحث إلى دراسة تحليل حساسية الكشف في مضخم أولي يستخدم كمرحلة أولى في المستقبلات الضوئية. بسبب أهمية هذا الموضوع في مقاييس المسافة الليزرية و فُضلتِ المعاملات المؤثرة في قياس المسافة باستخدام تقنية قياس المسافة بقياس زمن الطيران. ثم أنجز تحلي ل الضجيج في المضخمات الأولية و حسِبت نسبة الإشارة إلى الضجيج من أجل كشف إشارة بعرض نبضة 30 نانو ثانية بإدخال المعاملات على برنامج مكتوب باستخدام ماتلاب. طبقت نتائج الدراسة على عدة أنواع مضخمات أولية لتحديد أقل استطاعة ضوئية تُكشفُ .
تم جمع 204 عيّنة من عينات الجسم المختلفة خلال عام 2016 توزعت على الشكل التالي : 133 عيّنة من البول ، 37 عيّنة من حروق و جروح ، 10 عيّنات من أذن و بلعوم ، 12 عيّنة من البراز ، 8 عيّنات من السائل الدماغي الشوكي (CSF), عيّنات من الدم . أوضحت الدراسة سيادة سلبيات الغرام و قد بلغ عدد عزلاتها 136 بنسبة 67 % مقابل إيجابيات الغرام التي بلغ عدد عزلاتها 68 بنسبة %33 و سيطرت الإشريكية القولونية بنسبة 39.68 % من مجموع عزلات الجراثيم سلبية الغرام. أظهرت الدراسة زيادة نسبة مقاومة الإشريكية القولونية لنوع أو أكثر من الصادات الحيوية ، فقد بلغت مقاومتها 100 % للجيل الثاني و الثالث و الرابع من السيفالوسبورينات. كما أظهرت الدراسة بوضوح ظهور مقاومة لصادات نوعية و فعالة مثل الإيميبينيم.
التعليقات
جاري جلب التعليقات جاري جلب التعليقات
سجل دخول لتتمكن من متابعة معايير البحث التي قمت باختيارها
mircosoft-partner

هل ترغب بارسال اشعارات عن اخر التحديثات في شمرا-اكاديميا