تقييم خوارزميات الأمثلة متعددة الأهداف في حل مسألة ارتباط الجزيئات


الملخص بالعربية

تعتبر مسألة إيجاد الحل الأمثل لمسألة الارتباط الجزيئي بين المركبات من المسائل الصعبة. عند حل المسألة باستخدام الخوارزميات التي تتبع النهج الوحيد الهدف تكون النتائج متغيرة و معقدة. لا يمكن العثور إلاّ على عدد قليل من الأوراق البحثية التي تتناول هذه المسألة عن طريق اتباع النهج متعدد الأهداف، كما لم يتم بذل الجهد الكافي لإجراء مقارنات تجريبية في سبيل توضيح أفضل أداء لأفضل خوارزمية. يكمن هدف هذا البحث في استخدام مجموعة من خوارزميات الأمثلة متعددة الأهداف و المقارنة بينها لحل مسألة ارتباط الجزيئات بين المركبات.

المراجع المستخدمة

Goodsell- D.S., Morris- G.M, 1998- Automated docking using a Lamarckian genetic algorithm and an empirical binding free energy function- pp.1639–166
Roy- R, Oduguwa- A., Tiwari- A, 2006- Multi-objective optimisation of the protein-ligand docking problem in drug discovery- Proceedings of the 8th Annual Conference on Genetic and Evolutionary Computation- Seattle- USA- pp. 1793–1800
Grosdidier- A., Zoete- V.- Michielin- O, 2007- EADock: Docking of small molecules into protein active sites with a multi-objective evolutionary optimization- pp. 1010–1025

تحميل البحث