تقييم خوارزميات الأمثلة متعددة الأهداف في حل مسألة ارتباط الجزيئات

تعتبر مسألة إيجاد الحل الأمثل لمسألة الارتباط الجزيئي بين المركبات من المسائل الصعبة. عند حل المسألة باستخدام الخوارزميات التي تتبع النهج الوحيد الهدف تكون النتائج متغيرة و معقدة. لا يمكن العثور إلاّ على عدد قليل من الأوراق البحثية التي تتناول هذه المسألة عن طريق اتباع النهج متعدد الأهداف، كما لم يتم بذل الجهد الكافي لإجراء مقارنات تجريبية في سبيل توضيح أفضل أداء لأفضل خوارزمية. يكمن هدف هذا البحث في استخدام مجموعة من خوارزميات الأمثلة متعددة الأهداف و المقارنة بينها لحل مسألة ارتباط الجزيئات بين المركبات.

Molecular docking is a hard optimization problem that has been tackled in the past, demonstrating new and challenging results when looking for one objective . However, only a few papers can be found in the literature that deal with this problem by means of a multi-objective approach, and no experimental comparisons have been made in order to clarify which of them has the best overall performance. In this research, we use and compare, a set of representative multi-objective optimization algorithms. The approach followed is focused on optimizing the inter-molecular and intra-molecular energies as two main objectives to minimize.